Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003208`

染色体: Chr08 坐标: 32901288-32903108 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003208`
名称	SmilChr08G003208
描述	NAC domain-containing protein 26-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32901288 - 32903108 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998345`
GeneID	`130998345`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998345`
原始查询	`SmilChr08G003208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 26-like
产物	NAC domain-containing protein 26-like
Arabidopsis	`AT1G77450` (NAC032) NAC domain containing protein 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844081] identity=47; qcov=0.295; evalue=5.86e-17; confidence=weak
Rice	`Os01g0884300` (OsNAC6) - identity=34.1; qcov=0.47; evalue=1.07e-15; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998345

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779754.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779754.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779754.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779754.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32901311`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	93	A1,A11,A15,A20,A22,A3,A7,A9,B1,B104,B111,B117,B12,B120,B126,B127,B131,B134,B136,B137,B139,B16,B2,B20,B21,B26,B29,B3,B30,B31,B37,B41,B43,B49,B5,B55,B56,B6,B61,B62,B63,B65,B71,B73,B77,B8,B80,B82,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B91,B99,C10,C11,C12,C15,C16,C19,C2,C23,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C47,C49,C51,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C66,C70,C74,C8,C84,C87,C9,D11,D2,D5,D9
`Chr8:32901352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B34,C20,D11
`Chr8:32901357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:32901365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C8
`Chr8:32901382`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B131,B30,B41,B80,C15,C6,C66,C87
`Chr8:32901386`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B131,B30,B41,B80,C15,C6,C66,C87
`Chr8:32901398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B80,C6,C66,C87
`Chr8:32901403`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C6,C87
`Chr8:32901403`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C6,C87
`Chr8:32901407`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C6,C87
`Chr8:32901407`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C6,C87
`Chr8:32901410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923771.1
ATGTACGAGATGTTGGCCGAGATCAACCGCAAAATTGACAAAAGACTTGAGTCCATTGCAAGTAGAATTGGCTATGACTTTGACATTTCCAAGGCGAAAAATGAGGTCTTCGCACAATTGAGCTCAATCCAGGGTTTGTCTCTCAAAGCAAAGTTCGAGATCACCAATTTGCTTGCCAAAGAAGTGGAGCGTCTTGATGTGTTCACTAGTCTATCGGAAGAGTGGAAGTCGGAGTACGTCCACTACCTACTCGAGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998345
ATGTACGAGATGTTGGCCGAGATCAACCGCAAAATTGACAAAAGACTTGAGTCCATTGCAAGTAGAATTGGCTATGACTTTGACATTTCCAAGGCGAAAAATGAGGTCTTCGCACAATTGAGCTCAATCCAGGGTTTGTCTCTCAAAGCAAAGTTCGAGATCACCAATTTGCTTGCCAAAGAAGTGGAGCGTCTTGATGTGTTCACTAGTCTATCGGAAGAGTGGAAGTCGGAGTACGTCCACTACCTACTCGAGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779754.1
MYEMLAEINRKIDKRLESIASRIGYDFDISKAKNEVFAQLSSIQGLSLKAKFEITNLLAKEVERLDVFTSLSEEWKSEYVHYLLEEKYKYNGSTDCRPWKSEDQQILAAVPMRNRRALEFYEGKPPNGQKTVWKMHEFRVNGVTRKKTSADDMRLDDWVLCRVYAKSSRVINNRKSPLQANREAALVTNQEMIENASIVPENPEQNMINTDFSVQDLLQESDLRLSYFQSYNLDGIVAPIEQQLMNNPYVNGELLPLPLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器