当前解析结果
SmilChr08G003212| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003212 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003212 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003212 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 32934580 - 32936370 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997791 |
|---|---|
| GeneID | 130997791 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997791 |
| 原始查询 | SmilChr08G003212 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | actin T1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820144]; symbol=AT3G09860; hit=AT3G09860; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | actin T1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820144]; symbol=AT3G09860; hit=AT3G09860; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G09860 (AT3G09860)actin T1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820144] identity=85.7; qcov=1; evalue=2.1e-60; confidence=high |
| Rice | Os03g0578200- identity=39.5; qcov=0.776; evalue=2.55e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997791 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057779204.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057779204.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057779206.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779204.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779204.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:32934785 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B26,C83 |
Chr8:32936037 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B12 |
Chr8:32936037 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr8:32936063 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr8:32936071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C8 |
Chr8:32936073 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B16,C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。