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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003221`

染色体: Chr08 坐标: 33073433-33075398 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003221`
名称	SmilChr08G003221
描述	uncharacterized SmilChr08G003221
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33073433 - 33075398 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998350`
GeneID	`130998350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998350`
原始查询	`SmilChr08G003221`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779758.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779758.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057779758.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779758.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779758.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33073457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C32,C38,C68,C71,D2
`Chr8:33073478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B13
`Chr8:33073493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C24,C3
`Chr8:33073496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr8:33073499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:33073517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A8
`Chr8:33073533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B104,B129,B132,D11
`Chr8:33073534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:33073540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:33073619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,C85
`Chr8:33073630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C46
`Chr8:33073639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A20,A8,B106,B15,B47,B77,B82,B94,C16,C23,C42,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779758.1

524 aa

262

524

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 211-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779758.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	211	276	1.4e-11	45.3	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923775.1
ATGGGTTCCTCTGAAACTCGCCGTATTCTGGAGAAGGAGTTCGACAACGTGGGATCTGGCTCTGCTGCCCACACTACTGAAGTGCCCACCTTGTTATTTAATGGGCTGCCCACCAGCACCATCTTCACTGCACCGCCGGGTTTTCACACCGTCTCAGCCACTCCGCCGTCAGGGCAAAGTGTTGGGGTCCAGAGATTTGCTCTGGAGGAGAGGCCGAAGGAGAAAGCACGACTGAAAAACCAGGTGTCGCAACTGAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998350
ATGGGTTCCTCTGAAACTCGCCGTATTCTGGAGAAGGAGTTCGACAACGTGGGATCTGGCTCTGCTGCCCACACTACTGAAGTGCCCACCTTGTTATTTAATGGGCTGCCCACCAGCACCATCTTCACTGCACCGCCGGGTTTTCACACCGTCTCAGCCACTCCGCCGTCAGGGCAAAGTGTTGGGGTCCAGAGATTTGCTCTGGAGGAGAGGCCGAAGGAGAAAGCACGACTGAAAAACCAGGTGTCGCAACTGAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779758.1
MGSSETRRILEKEFDNVGSGSAAHTTEVPTLLFNGLPTSTIFTAPPGFHTVSATPPSGQSVGVQRFALEERPKEKARLKNQVSQLKHQLEDLEESLREKSRRDDRGQRSGKSNKAERSYRAERSHRSEKSRYIEKSEEQELEYSFGRPGRKDHKRPHAHDSPRDRREHGRDKEDKRAKTSRFHPINNRSPFSDDILADTLPRSYKPISLDYDGTTDPEVHLNRFEGLVTLHMYTEGIKCRIFSTTLTGPAQLWFGTLAPN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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