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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003224`

染色体: Chr08 坐标: 33109112-33110901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003224`
名称	SmilChr08G003224
描述	uncharacterized SmilChr08G003224
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33109112 - 33110901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997798`
GeneID	`130997798`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997798`
原始查询	`SmilChr08G003224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0564500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0564500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G36930` (AT2G36930) zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818267] identity=72.4; qcov=0.975; evalue=8.59e-61; confidence=high
Rice	`Os08g0564500` - identity=69.4; qcov=1.04; evalue=1.28e-61; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12171 (zf-C2H2_jaz)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997798

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779211.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057779211.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779211.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779211.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33109527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B51,C35
`Chr8:33109782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779211.1

119 aa

119

zf-C2H2_jaz

PF12171 zf-C2H2_jaz 58-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779211.1`	Pfam	`PF12171`	zf-C2H2_jaz	Family	58	84	6.1e-09	36.5	Zinc-finger double-stranded RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923228.1
GTTATGGGCTTTCAAATTAATAATGTTCAGTGATATGGTCCAAGAGCTCTTTATACTTGGTCACATACACAAAGTCGCAGTTGAACAAATAAATAACAAGCCTTCTACCAGAAACAAGCCTTTGCGGCTTCACCGCCATCTAGGGTTTTCGGTTTCTCAATTCCGACCAAATCAAAAATTCGAATTTCCCAATTTGCTTCATACATTGAAGAAGAATGGGCGGAAAGTGTCCGCACAGGAGTGTGAAGAAGCGTCGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997798
ATGGGCGGAAAGTGTCCGCACAGGAGTGTGAAGAAGCGTCGCTACTCTCATAAATCATTTAGGCGCAGCAAATTTCTTATCAAGGGCGACGACGCCGTTTACGATGAGCTTCAGAAAGCGGAGGGACAGAGCAAGCCCTTGCCCGTGGATGAAGATCTTCCAGGAATGGGCCAGTACTATTGTTTTCACTGCGATCGCTATTTTGCTAATGTGGCTGTCAGAGATGAACATTTCAAGACCAAGCGGCATAGGAAACGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779211.1
MGGKCPHRSVKKRRYSHKSFRRSKFLIKGDDAVYDELQKAEGQSKPLPVDEDLPGMGQYYCFHCDRYFANVAVRDEHFKTKRHRKRVKIMMGPAPHTQLDADIAAGMGKPDNGPKLMSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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