当前解析结果
SmilChr08G003227| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003227 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003227 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003227 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 33198148 - 33201586 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997800 |
|---|---|
| GeneID | 130997800 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997800 |
| 原始查询 | SmilChr08G003227 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | D-tagatose-1,6-bisphosphate aldolase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818263]; symbol=AT2G36895; hit=AT2G36895; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | D-tagatose-1,6-bisphosphate aldolase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818263]; symbol=AT2G36895; hit=AT2G36895; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G36895 (AT2G36895)D-tagatose-1,6-bisphosphate aldolase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818263] identity=63.3; qcov=1.01; evalue=3.09e-104; confidence=high |
| Rice | Os03g0152600- identity=73.1; qcov=0.752; evalue=1.86e-96; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25103 (DUF7811) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997800 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057779213.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057779213.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.40000 | XP_057779213.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779213.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779213.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:33198415 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,B97,C33 |
Chr8:33200029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:33200214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr8:33201458 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C4 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057779213.1PF25103
DUF7811 120-242 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057779213.1 |
Pfam | PF25103 |
DUF7811 | Domain | 120 | 242 | 1.4e-66 | 222.5 | Domain of unknown function (DUF7811) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。