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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003229`

染色体: Chr08 坐标: 33221595-33222386 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003229`
名称	SmilChr08G003229
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33221595 - 33222386 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998353`
GeneID	`130998353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998353`
原始查询	`SmilChr08G003229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=32; qcov=0.97; evalue=4.59e-27; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24769 (At2g29880_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779760.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779760.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779760.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779760.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33221637`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A4,A6,B11,B114,B127,B130,B14,B16,B17,B39,B54,B67,B80,B87,C20,C22,C32,C38,C63,C68,C7,C76,C86,D9
`Chr8:33221660`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B30,B58,B65,B88,C14,C39,C64,C66,C69
`Chr8:33221711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B135,B70,C4,C65
`Chr8:33221742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C40
`Chr8:33221742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr8:33221763`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A21,B126,B17,B95,C14,C18,C41,C55,C78,C82
`Chr8:33221770`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,B113,C11
`Chr8:33221770`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A11,B113,C11
`Chr8:33221833`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C22
`Chr8:33221833`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C22
`Chr8:33221846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:33221904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779760.1

235 aa

118

235

At2g29880_C

PF24769 At2g29880_C 187-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779760.1`	Pfam	`PF24769`	At2g29880_C	Domain	187	232	4.8e-21	75.6	At2g29880 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923777.1
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAATGCTAAAAAGTTCACGACCTCGGATGAAGTATGGGATGCATACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTGTCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGTTGTTGGAAACGATGTGGCTATAGGGAAAAACTCAATCGGATTAGGTAGTGCTACTGATGCTAGGACATTAGGAGTTGATGAAAATAGAGCTAGGCAAATAGGGGAGTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998353
ATGAAGTTTAACTCTGGTTTTGGCTATGACAACAATGCTAAAAAGTTCACGACCTCGGATGAAGTATGGGATGCATACTGTCAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTGCGCCATGGGAATTGTCCGGATTATGAAGACTTGGAAATTGTTGTTGGAAACGATGTGGCTATAGGGAAAAACTCAATCGGATTAGGTAGTGCTACTGATGCTAGGACATTAGGAGTTGATGAAAATAGAGCTAGGCAAATAGGGGAGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779760.1
MKFNSGFGYDNNAKKFTTSDEVWDAYCQAHPKDAYLRHGNCPDYEDLEIVVGNDVAIGKNSIGLGSATDARTLGVDENRARQIGELNYDAENEAFVGLTQDNPPSSGSKSPLEPPEVSVDSSQRRAPAKRSRGQFEVNSGHTENSSHQEFMAEIKKITTTVDGVQSLLVKRDTVLEKREREKTYTTWDVIKEIPDLTEDVRIKAFDLLDTKSKKDGFLKMTVDERKSWIAYKIRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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