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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003237`

染色体: Chr08 坐标: 33284040-33285220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003237`
名称	SmilChr08G003237
描述	zinc transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33284040 - 33285220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997811`
GeneID	`130997811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997811`
原始查询	`SmilChr08G003237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc transporter 1-like
产物	zinc transporter 1-like
Arabidopsis	`AT3G12750` (ZIP1) zinc transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820457] identity=47.2; qcov=0.61; evalue=1.74e-23; confidence=medium
Rice	`Os05g0472700` (OsZIP5) - identity=42.3; qcov=0.734; evalue=5.1e-18; confidence=low
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport); GO:0046873 (metal ion transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02535 (Zip)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057779233.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057779233.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779233.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779233.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33284197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:33284245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr8:33284309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,A5,B101,B53,B70
`Chr8:33284373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C11,C40,C69,C70,C76
`Chr8:33284377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B71,C1,C17,C40
`Chr8:33284379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr8:33284432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B84,C17,C84,D4
`Chr8:33284449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B84,C17,C84,D4
`Chr8:33284453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B84,C17,C84,D4
`Chr8:33284454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C76
`Chr8:33284469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B84,C17,C84,D4
`Chr8:33284484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C69,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779233.1

177 aa

177

Zip

PF02535 Zip 60-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779233.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	60	127	1.5e-09	38.3	ZIP Zinc transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923250.1
CAGTAGCCGACGCCGGCCGTCGGTCGCTGCCGAATCTCCCTCTGACCCCTATCTCCGACTCAACAGAACACGCACACACAGAGACACACTCACGACACACAAAACACCACAACGAGAGGAACTTTCAGATGTATACTGAAATCAAATTACTGATATGGAAGATATATTGGACTCTACACTCTTACCCCACTTCAGATCACTCTGCGCCATGGCCACTACTCACAAAATAATCTTCCTCATGGTTATCTCAGCCGCCGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997811
ATGGAAGATATATTGGACTCTACACTCTTACCCCACTTCAGATCACTCTGCGCCATGGCCACTACTCACAAAATAATCTTCCTCATGGTTATCTCAGCCGCCGCCTCAGCGGCCGCAGACGACTGCATGAGATACGACACCGAAGCCGAGGAAGGCAACAAGAGCGAAGCCCTAAAGCTGAAACTGGTGGCGATTGCTTCGATCCTCACCGCGGGCATCAAATTCCCGCTCCTCGGTCGAAAGCTGCTCGTTCTCCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779233.1
MEDILDSTLLPHFRSLCAMATTHKIIFLMVISAAASAAADDCMRYDTEAEEGNKSEALKLKLVAIASILTAGIKFPLLGRKLLVLLPENDRFLMVKAFAGGVVLATGFVHILPDAFRRLTPASATHHGPNSPSRDSSPWRPPSPRKEAALRGLATSPRSESCKTPGGGGWEVLGAIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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