Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003241`

染色体: Chr08 坐标: 33311233-33312888 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003241`
名称	SmilChr08G003241
描述	uncharacterized SmilChr08G003241
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33311233 - 33312888 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998354`
GeneID	`130998354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998354`
原始查询	`SmilChr08G003241`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998354

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

特征证据限制：抽查两个保留的历史缓存共 206 行，PROFEAT 特征全部为零；第二块缓存为 106 行，比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实，不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测，也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选，特征完整性与预测可靠性尚未建立。

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779762.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779762.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779762.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057779762.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33311245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,C6,C63,C69,C83
`Chr8:33311247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:33311284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B117,C16,C61
`Chr8:33311284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C16,C61
`Chr8:33311285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C50
`Chr8:33311292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:33311298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B127,B135,B20,C50
`Chr8:33311299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:33311308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:33311316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B25,B90,D2
`Chr8:33311319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:33311327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923779.1
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGACAGAATGACAACAACAACAAGAGGACCCTTCGAGACATGATGTTCCCAAGCAACCTGAATCTCAGGCCGTCAGCAATAGTGTTACCCGAGATCACTGGAAATTGGGAGTTGAAGCATACACTAATCCAAATTTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGGGAAGACCCTCAAAGACATTTACAAGACTTTGAGATGACGTGTGGAACAGTGCGCACCGCAAGTCTAGCCCTTGGCGAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057779762.1_44484
ATGGCAGAAAATCCGGAAGGACAGAATGACAACAACAACAAGAGGACCCTTCGAGACATGATGTTCCCAAGCAACCTGAATCTCAGGCCGTCAGCAATAGTGTTACCCGAGATCACTGGAAATTGGGAGTTGAAGCATACACTAATCCAAATTTTGCCCAAGTACAGTGATATGCCCGGGGAAGACCCTCAAAGACATTTACAAGACTTTGAGATGACGTGTGGAACAGTGCGCACCGCAAGTCTAGCCCTTGGCGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779762.1
MAENPEGQNDNNNKRTLRDMMFPSNLNLRPSAIVLPEITGNWELKHTLIQILPKYSDMPGEDPQRHLQDFEMTCGTVRTASLALGEYIRLLTFPFSLLEGAREWLYDLPEGSIRTWQELQSKFLERYFPAVRIQNLRTRISNIKMGTGEILYEYWGRFKQMLAKCPQHQIPDHDLIRYFVGGLRKQDRQWLHAACGGSILNKSAAEAFKLIADMAEESRDEEGTIVRTTPVPAPSAQDEKLDKLCNMFEKFMTNQGTPNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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