当前解析结果
SmilChr08G003243| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003243 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003243 |
| 描述 | lysine-rich arabinogalactan protein 17-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 33316961 - 33317434 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998356 |
|---|---|
| GeneID | 130998356 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998356 |
| 原始查询 | SmilChr08G003243 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | lysine-rich arabinogalactan protein 17-like |
| 产物 | lysine-rich arabinogalactan protein 17-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998356 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779764.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057779764.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057779764.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779764.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779764.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:33316984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B68,D4 |
Chr8:33316991 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A13,B105,B122,B36,B40,B55,B62,B67,B69,B94,B98,C1,C10,C2,C30 |
Chr8:33316992 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr8:33317026 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr8:33317043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B11,B121,C39,C85 |
Chr8:33317052 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,D3 |
Chr8:33317061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B94,C34,C40,C55 |
Chr8:33317071 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,B126,C33,C37 |
Chr8:33317075 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B94 |
Chr8:33317076 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C26,C59 |
Chr8:33317077 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B125 |
Chr8:33317085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B52,B94,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。