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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003249`

染色体: Chr08 坐标: 33455613-33456062 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003249`
名称	SmilChr08G003249
描述	uncharacterized SmilChr08G003249
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33455613 - 33456062 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998361`
GeneID	`130998361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998361`
原始查询	`SmilChr08G003249`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779766.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779766.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057779766.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779766.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33455625`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr8:33455625`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr8:33455641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C87
`Chr8:33455641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:33455662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B138,B31,B54,C51
`Chr8:33455663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B30,C39
`Chr8:33455667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B105
`Chr8:33455718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B105
`Chr8:33455721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B105
`Chr8:33455722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B113,B56,B96
`Chr8:33455735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:33455753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	54	A14,A16,A18,A24,A3,A8,A9,B109,B113,B122,B126,B130,B27,B36,B40,B45,B53,B56,B62,B63,B64,B71,B76,B78,B79,B81,B83,B85,B88,B89,B90,B96,C1,C11,C16,C20,C26,C32,C4,C42,C52,C53,C56,C60,C67,C71,C72,C78,C86,D1,D2,D3,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779766.1

149 aa

149

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 19-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779766.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	19	46	2.6e-06	28.7	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923783.1
ATGAATGGCGACAAGCGAAAACCTCCTGAAAAGGAATGTTACATTCCGACCCAAGACATCTCTTGTGTGCTCTGTCAAGAGAAGACCGAAGACTCAAATCACCTTTTCTTCTCCTGTCAAAAAGCAACAGAAGTCTGGTACGATCTCCTTTCGTGGATTGGGAAATCTGCTGCTTTACATTCAAGCGCGAGCAACCACCTGATGGGTTTCTCTAATATTGGACACAAGAAGGATATTCTTTTTCTGACTGGACTTTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998361
ATGAATGGCGACAAGCGAAAACCTCCTGAAAAGGAATGTTACATTCCGACCCAAGACATCTCTTGTGTGCTCTGTCAAGAGAAGACCGAAGACTCAAATCACCTTTTCTTCTCCTGTCAAAAAGCAACAGAAGTCTGGTACGATCTCCTTTCGTGGATTGGGAAATCTGCTGCTTTACATTCAAGCGCGAGCAACCACCTGATGGGTTTCTCTAATATTGGACACAAGAAGGATATTCTTTTTCTGACTGGACTTTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779766.1
MNGDKRKPPEKECYIPTQDISCVLCQEKTEDSNHLFFSCQKATEVWYDLLSWIGKSAALHSSASNHLMGFSNIGHKKDILFLTGLWICTVWCIWKKRNDIRFKQGKWSRDGVTAEIKSHVWSWLQVFSKYGSSADFSFRDWFNVVPLAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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