当前解析结果
SmilChr08G003264| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003264 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003264 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003264 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 33658124 - 33660182 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997833 |
|---|---|
| GeneID | 130997833 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997833 |
| 原始查询 | SmilChr08G003264 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997833 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779248.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057779248.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057779248.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779248.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779248.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:33658254 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658254 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658261 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658261 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658265 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B130,B25,B33 |
Chr8:33658273 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,C54,C66 |
Chr8:33658278 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr8:33658297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,B67 |
Chr8:33658317 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A11,A20,A9,B106,B123,B133,B29,B50,B73,B74,B80,B95,C1,C12,C28,C46,C48,C77,C83,C87 |
Chr8:33658326 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B45,B65,B73,C44 |
Chr8:33658332 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C26,C61,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。