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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003274`

染色体: Chr08 坐标: 33832395-33833638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003274`
名称	SmilChr08G003274
描述	zinc finger protein ZAT5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33832395 - 33833638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997842`
GeneID	`130997842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997842`
原始查询	`SmilChr08G003274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT5-like
产物	zinc finger protein ZAT5-like
Arabidopsis	`AT5G03510` (AT5G03510) C2H2-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831818] identity=41.6; qcov=1.22; evalue=2.16e-52; confidence=medium
Rice	`Os04g0162500` - identity=36.9; qcov=1.11; evalue=4.3e-33; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF13894 (zf-C2H2_4); PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779256.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779256.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779256.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779256.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779256.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33832822`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B135
`Chr8:33832822`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B135
`Chr8:33832825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:33832892`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A18,A19,A22,A25,A3,A8,B1,B108,B109,B110,B112,B113,B12,B122,B128,B130,B134,B140,B15,B16,B20,B22,B23,B24,B26,B3,B31,B32,B37,B38,B39,B44,B45,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B6,B61,B62,B64,B73,B76,B87,B88,B95,B96,B99,C10,C11,C12,C20,C21,C26,C28,C3,C31,C41,C42,C44,C46,C48,C5,C58,C59,C62,C69,C70,C75,C77,C79,C82,C83,C86,D10,D11,D2,D4,D5,D9
`Chr8:33832893`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C8
`Chr8:33832893`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C8
`Chr8:33832912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:33832928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779256.1

235 aa

118

235

zf-C2H2_6

zf-C2H2

zf-C2H2_6

zf-C2H2_4

PF13912 zf-C2H2_6 79-105 aa PF00096 zf-C2H2 80-102 aa PF13912 zf-C2H2_6 155-180 aa PF13894 zf-C2H2_4 156-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779256.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	79	105	9.5e-27	93.1	C2H2-type zinc finger
`XP_057779256.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	80	102	2.1e-06	28.6	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057779256.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	155	180	9.5e-27	93.1	C2H2-type zinc finger
`XP_057779256.1`	Pfam	`PF13894`	zf-C2H2_4	Domain	156	178	5.9e-10	39.7	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923273.1
AGGAATCGTTCCCAAAAAGTAATGGGTTTGCTTCAAAGCCAACCGATTCTCACTCCTTCCCTCACTCCATTACATCACAAACAACCACACCTATATACATATATAAATATATATATATAATTCGTGTTTGTGTATCTCAGTTGTTTAAGTTTCCTACGTTAGTACACTTCCTAAGTTGCGACTGCAAGAAAAGAAGAACATCATAAGTGAGCACATTTTCACCTTTCTAATTTTCAGACATCCATTCACTTCTATATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997842
ATGCTGCAGGAAGTTACTATGATCAAGGGGAAGCGGAGCAAGCGGCCTCGCTCCGCCTCCCCTCTCGCCCTAACCATCGCCACCAGCTCCGAGCTCAGCGGTGGTGGTGGAGCTGTTGGCGACGGCGTTATAAGCGACGTCTCGCCTTCCCATTCACATGATGAGGAGGAGGAAGATATGGCGAATTGTTTGATCCTCCTGGCCAAAGGGAGGTCATCACAGCCGGCCGCGGAGGCGTACCAGTGCAAAACGTGTAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779256.1
MLQEVTMIKGKRSKRPRSASPLALTIATSSELSGGGGAVGDGVISDVSPSHSHDEEEEDMANCLILLAKGRSSQPAAEAYQCKTCSKSFSSFQALGGHRASHKKPIKPEEKKPLMREKQERECFQLAERDDSTNLSLQISNRSASSGSPQSKTRVHECSICGAEFGSGQALGGHMRRHRPIPAVASGGVKKARNLLSLDLNLPAPEDDQPESKFPFATKEQVIVFAASPLIDCHY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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