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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003280`

染色体: Chr08 坐标: 33934644-33942838 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003280`
名称	SmilChr08G003280
描述	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 9-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	33934644 - 33942838 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997847`
GeneID	`130997847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997847`
原始查询	`SmilChr08G003280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 9-like
产物	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 9-like
Arabidopsis	`AT3G09920` (PIP5K9) phosphatidyl inositol monophosphate 5 kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820151] identity=72; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0822500` (OJ1119_A01.22-1) - identity=69.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016308 (1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity); GO:0046488 (phosphatidylinositol metabolic process)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01504 (PIP5K); PF02493 (MORN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057779259.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057779259.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779259.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779259.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779259.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:33935046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B55,C22
`Chr8:33936237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C22
`Chr8:33938327`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	89	A10,A13,A19,B10,B105,B109,B111,B112,B113,B114,B120,B121,B122,B123,B125,B128,B129,B131,B132,B137,B139,B14,B16,B17,B19,B23,B24,B29,B34,B36,B38,B39,B4,B44,B46,B50,B52,B53,B54,B56,B58,B6,B62,B69,B7,B73,B74,B75,B79,B82,B84,B85,B93,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C17,C21,C24,C25,C29,C30,C33,C34,C36,C46,C50,C52,C53,C54,C60,C65,C7,C71,C73,C75,C76,C79,C87,C9,D1,D6,D8
`Chr8:33938349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B46
`Chr8:33940477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:33940736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:33941215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr8:33941360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779259.1

835 aa

418

835

MORN

PIP5K

PF02493 MORN 65-86 aa PF02493 MORN 88-108 aa PF02493 MORN 111-132 aa PF02493 MORN 134-155 aa PF02493 MORN 157-179 aa PF02493 MORN 180-201 aa PF02493 MORN 203-224 aa PF02493 MORN 226-245 aa PF01504 PIP5K 497-826 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	65	86	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	88	108	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	111	132	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	134	155	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	157	179	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	180	201	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	203	224	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	226	245	1.7e-45	150.9	MORN repeat
`XP_057779259.1`	Pfam	`PF01504`	PIP5K	Family	497	826	5.4e-101	338.4	Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-Kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923276.1
TGATGTGATAAGATGTAAACGTTATTCTAATGTCCACAAAGCACTTTGCAGTTTTAAGTTACTCCAGTTTATTGCATTTAACGAGATTCGTCTCCTTCGGAAAATTTATTTTTCTTATTTTAGGATCGAATCCATCGAAAAAGAGCTCAACTGAAATTTAACAGAATAAGGAAACACAATTGCTTTTCTGCCCAACTCTCATCATCATTCTCCCTTCCGCTGCATTAAAGGGCACGAAAGAGCGGAATTTTGGAAGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997847
ATGTCTGGCCCTGTGGCCACTGCGAGTAATGTTGAAAGAGGTCTCTCTATATCTAGTAGGACAAAGTCACTTGATTCCTCAATATCTAAGGAGAAAAGCCGCTTAAATGAATTGAATGGAGAGGTCTCTCATTCTTCATCAGAAACTAACAGCTTCAGAGCTGGAAAGATTTCATTGCGCAACGGAGAGTCTTATTCTGGATTCCTGCTTGGCAATGTACCAGAGGGGTCAGGGGATTATGTCTGGTCCGATGGTTGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779259.1
MSGPVATASNVERGLSISSRTKSLDSSISKEKSRLNELNGEVSHSSSETNSFRAGKISLRNGESYSGFLLGNVPEGSGDYVWSDGCKYDGEWRSGMRHGHGKLQWPSGAIYEGEFSGGYMHGNGTYTRPDKTTYKGRWRLNLKHGLGYQDFPNRDVFEGSWIQGSPEGPGKYTWANGNVYLGNMKGGKMSGKGTLTWTNGDSYEGNWLNGMMHGFGVYTWVDGGCYVGTWTRGLKDGKGTFYPNGRKLPASQQLYLNALR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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