当前解析结果
SmilChr08G003316| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003316 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003316 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003316 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 34391154 - 34397421 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997877 |
|---|---|
| GeneID | 130997877 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997877 |
| 原始查询 | SmilChr08G003316 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997877 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779289.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057779289.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057779289.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057779289.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779289.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:34391639 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | A22,B1,B16,B28,B4,B96,C31,C46,C50,C61 |
Chr8:34391646 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr8:34391661 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr8:34391671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B62,C31,C41,C75 |
Chr8:34391675 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B67,C16,C62,D3 |
Chr8:34391676 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 21 | A18,B106,B107,B13,B140,B17,B2,B33,B44,B46,B7,C13,C23,C24,C32,C33,C68,C78,C82,D11,D6 |
Chr8:34391684 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B58 |
Chr8:34391684 |
T |
TTC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B58 |
Chr8:34391685 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | D6 |
Chr8:34391685 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:34391686 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | A11,A9,B135,B38,B39,C34,D6 |
Chr8:34391696 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。