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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003317`

染色体: Chr08 坐标: 34398398-34402917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003317`
名称	SmilChr08G003317
描述	vacuolar protein-sorting-associated protein 37 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34398398 - 34402917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997878`
GeneID	`130997878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997878`
原始查询	`SmilChr08G003317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein-sorting-associated protein 37 homolog 1-like
产物	vacuolar protein-sorting-associated protein 37 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT2G36680` (AT2G36680) Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818240] identity=63.2; qcov=0.977; evalue=4.01e-92; confidence=high
Rice	`Os03g0186800` - identity=58.7; qcov=1.02; evalue=2.15e-80; confidence=high
GO	GO:0000813 (ESCRT I complex); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0006623 (protein targeting to vacuole); GO:0043162 (ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07200 (Mod_r)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779291.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057779291.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779292.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057779291.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057779291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34399501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:34402672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779291.1

233 aa

116

233

Mod_r

PF07200 Mod_r 78-222 aa

XP_057779292.1

214 aa

107

214

Mod_r

PF07200 Mod_r 59-203 aa

XP_057779293.1

214 aa

107

214

Mod_r

PF07200 Mod_r 59-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779291.1`	Pfam	`PF07200`	Mod_r	Domain	78	222	4.6e-40	137.7	Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein
`XP_057779292.1`	Pfam	`PF07200`	Mod_r	Domain	59	203	3.6e-40	138.0	Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein
`XP_057779293.1`	Pfam	`PF07200`	Mod_r	Domain	59	203	3.6e-40	138.0	Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923308.1
GTAGAGAAGAAAGTGGTTAGGGAGAAAACCAACACGCTTAAGTAATTTAGTTTGAACTTGTGTAAACAAAACCACGTATACATTTTATCCCAAAAATACGTTTGTTTATAGAAAACGTAGAAGAAGAAAAGGGGAACCTAATCCAATCAAAATCCAATCTTGATGTAATTGGAATTTCCTGCTGATAAATCGATTGGGTGTTATTGGAAATTTTGATTCCCCTTCTTGTTTTATATTTTGATCAGACCACCGACGACTGA...

XM_057923309.1
TCTTCTTTTGCTGAAATGAATTGGGTGACCTACCAACGAGTGAAGCATGTTAGATACCATGATTGTTGGACAATTCCCAAGTTGTTGAAATTTATCTGCCTCTATCGGTGAAAAGAACGGCTTCGAGTCGAATCGTTAAGGAATTTTTAGTCTCTGGGGCTCTCAGGAGCCGCAACCTCAGACCCGTCCTCAGGAAATGCCCACAGACTCATGGTACCCACCTTCTGTCATTAGTTCATCCAGCTCCTCTCGCCCTACTA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997878
ATGTTCAAAAATTTCTGGGGCTCTCAGGAGCCGCAACCTCAGACCCGTCCTCAGGAAATGCCCACAGACTCATGGTACCCACCTTCTGTCATTAGTTCATCCAGCTCCTCTCGCCCTACTACACCTGGATCGAGTACATCTAGCAGCTTTGGCATATCAAGACCAACAGACCGACCAAATTCTTTGTCAAACGTTTCACCTGCAGAGGCTGCGGGCATCATTGCTATGTTGAAAGATAAGAGTGTTGATGAGCTGAGGAA...

LOC130997878
ATGCCCACAGACTCATGGTACCCACCTTCTGTCATTAGTTCATCCAGCTCCTCTCGCCCTACTACACCTGGATCGAGTACATCTAGCAGCTTTGGCATATCAAGACCAACAGACCGACCAAATTCTTTGTCAAACGTTTCACCTGCAGAGGCTGCGGGCATCATTGCTATGTTGAAAGATAAGAGTGTTGATGAGCTGAGGAAGCTTCTATCAGACAAGGATGCTTATCAGAATCTATTGTATTCACTGGAACCTGTCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057779291.1
MFKNFWGSQEPQPQTRPQEMPTDSWYPPSVISSSSSSRPTTPGSSTSSSFGISRPTDRPNSLSNVSPAEAAGIIAMLKDKSVDELRKLLSDKDAYQNLLYSLEPVKTQNRVRDELRNETLQLARENLEKEPRIMELRNQCRIIRTTELAAAQEKLHDLERKKDETLKYYSPSSLIHRLQDAMSKTEEESEALHQQLLDREIDLSAFVQKYKKMRHTYHKRALTHLAAKTSATS

XP_057779292.1
MPTDSWYPPSVISSSSSSRPTTPGSSTSSSFGISRPTDRPNSLSNVSPAEAAGIIAMLKDKSVDELRKLLSDKDAYQNLLYSLEPVKTQNRVRDELRNETLQLARENLEKEPRIMELRNQCRIIRTTELAAAQEKLHDLERKKDETLKYYSPSSLIHRLQDAMSKTEEESEALHQQLLDREIDLSAFVQKYKKMRHTYHKRALTHLAAKTSATS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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