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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003326`

染色体: Chr08 坐标: 34531807-34536807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003326`
名称	SmilChr08G003326
描述	uncharacterized SmilChr08G003326
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34531807 - 34536807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998382`
GeneID	`130998382`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998382`
原始查询	`SmilChr08G003326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=27.8; qcov=0.322; evalue=5.84e-41; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.5; qcov=0.452; evalue=2.09e-88; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998382

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779784.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779784.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779784.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779784.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34531814`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B134,B74,D7
`Chr8:34531814`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B134,B74,D7
`Chr8:34531816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34531843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B61,C21
`Chr8:34531856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B16
`Chr8:34531863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B16
`Chr8:34531865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:34531875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34531891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B110,B5,C5,C56
`Chr8:34531892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34531900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34531972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B133,B41,B71,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779784.1

1394 aa

697

1394

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 449-699 aa PF13966 zf-RVT 965-1035 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779784.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	449	699	4e-27	96.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057779784.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	965	1035	4.2e-13	50.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923801.1
ATGGCAGCTAGGACAGCAGCGAGTTATATCTCTTCACAAGCCGAAGATAATATTAAAAGCCGCTTGAGAAAATCTGGAGAAACAGGGCATAACCCACGTGAATATGTGATTGATACCAGCAGCAAGGGGAGTATTCAAGCCATGGATAATGTCTCGAAAGAAAGTTGGGCTGATGAGGTGATTATTGTGGAATGCTCCTGGCAGTCTCTTGATTTTTGTGTGGTTGTGGTTCACGGTTCTAATGATCATATTGAACGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998382
ATGGCAGCTAGGACAGCAGCGAGTTATATCTCTTCACAAGCCGAAGATAATATTAAAAGCCGCTTGAGAAAATCTGGAGAAACAGGGCATAACCCACGTGAATATGTGATTGATACCAGCAGCAAGGGGAGTATTCAAGCCATGGATAATGTCTCGAAAGAAAGTTGGGCTGATGAGGTGATTATTGTGGAATGCTCCTGGCAGTCTCTTGATTTTTGTGTGGTTGTGGTTCACGGTTCTAATGATCATATTGAACGACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779784.1
MAARTAASYISSQAEDNIKSRLRKSGETGHNPREYVIDTSSKGSIQAMDNVSKESWADEVIIVECSWQSLDFCVVVVHGSNDHIERRVLWCDLLRYASGCTVFIGDFNAVKGAHERRSSIFPLRASCLEFGSFIDDTHFIESPTEGLRFTCFSSSHFGSLTVGFTVSSSYPYVASSLQIFKHVGAPSHFMDMVSGSWSTPVNTLCPILSVMLKLKNLRACIRVWNKEVFGNVDSSIARLHNQLMDIQKIISETGYTDDLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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