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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003331`

染色体: Chr08 坐标: 34619659-34620801 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003331`
名称	SmilChr08G003331
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34619659 - 34620801 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997890`
GeneID	`130997890`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997890`
原始查询	`SmilChr08G003331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 12-like
产物	DNA-directed RNA polymerases II%2C IV and V subunit 12-like
Arabidopsis	`AT5G41010` (NRPB12) DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834103] identity=86.96; qcov=0.597; evalue=7.58e-26; confidence=medium
Rice	`Os01g0530366` - identity=87.23; qcov=0.597; evalue=6.9e-25; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03604 (Zn_ribbon_RPAB4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997890

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779305.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779305.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057779305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34619766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:34619963`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B101,B130
`Chr8:34619963`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B101,B130
`Chr8:34619967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B14,B15,B37
`Chr8:34619994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B33,C46,C8
`Chr8:34620006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B136,B25,C27
`Chr8:34620019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:34620022`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr8:34620022`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr8:34620023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B78,D10
`Chr8:34620030`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr8:34620030`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779305.1

77 aa

Zn_ribbon_RPAB4

PF03604 Zn_ribbon_RPAB4 6-44 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779305.1`	Pfam	`PF03604`	Zn_ribbon_RPAB4	Domain	6	44	2.1e-22	78.9	DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923322.1
ACCCACCTCTCATTCTCTGCTCAGCGCGCGACGACTTCAAAACCTAAATCCACATTTCCGTTCAATCCACTATGGATCCGCAGCCCGAACCCGTAAATTACATCTGCGGAGATTGTGGGCAGGAGAACACGCTGAAGCCAGGGGATGTGATCCAGTGCCGTGAATGTGGTTATCGCATCCTCTACAAGAAACGCACCCGCAGAAGTATTACTATTTCCCTTTTTCTTATTCTGCCTTATTGTTGCCTGTTTTTCGTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997890
ATGGATCCGCAGCCCGAACCCGTAAATTACATCTGCGGAGATTGTGGGCAGGAGAACACGCTGAAGCCAGGGGATGTGATCCAGTGCCGTGAATGTGGTTATCGCATCCTCTACAAGAAACGCACCCGCAGAAGTATTACTATTTCCCTTTTTCTTATTCTGCCTTATTGTTGCCTGTTTTTCGTTTCTCTTATCGTTTCGATTTCACATCTTAAATCATGGTACATACAATAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779305.1
MDPQPEPVNYICGDCGQENTLKPGDVIQCRECGYRILYKKRTRRSITISLFLILPYCCLFFVSLIVSISHLKSWYIQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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