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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003332`

染色体: Chr08 坐标: 34622481-34624715 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003332`
名称	SmilChr08G003332
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 12
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34622481 - 34624715 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997891`
GeneID	`130997891`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997891`
原始查询	`SmilChr08G003332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 12
产物	DNA-directed RNA polymerases II%2C IV and V subunit 12
Arabidopsis	`AT5G41010` (NRPB12) DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834103] identity=90.2; qcov=1; evalue=3.47e-30; confidence=medium
Rice	`Os01g0530366` - identity=92.3; qcov=1.02; evalue=1.39e-29; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03604 (Zn_ribbon_RPAB4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997891

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779306.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779306.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779306.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779306.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779306.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779306.1

51 aa

Zn_ribbon_RPAB4

PF03604 Zn_ribbon_RPAB4 6-44 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779306.1`	Pfam	`PF03604`	Zn_ribbon_RPAB4	Domain	6	44	7.5e-23	80.3	DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093242.1
CTCCCTTCCCTTCTTCTCCCCCCTATCAGCCGCACACACTGACACACGCATACACACCTTCACATCAGTTTCTCTCACTCTCCCTCAACTCTCGACTGTCTCTCTCGACTGCTCGAACTCACGGCCGCTGGAGCTCGCCGGAGCAAGCGGCGGCAACCATTACCTCTCGGTTCTCCCTTCTCTCGGTTCAAAACAGAGAATCACCGCCTCCGTCCATCTCTCTCTCACCGTGGCTGAAAGGTAGCGGCAAAGCCGCCGTG...

XM_057923323.1
CTCCCTTCCCTTCTTCTCCCCCCTATCAGCCGCACACACTGACACACGCATACACACCTTCACATCAGTTTCTCTCACTCTCCCTCAACTCTCGACTGTCTCTCTCGACTGCTCGAACTCACGGCCGCTGGAGCTCGCCGGAGCAAGCGGCGGCAACCATTACCTCTCGGTTCTCCCTTCTCTCGGTTCAAAACAGAGAATCACCGCCTCCGTCCATCTCTCTCTCACCGTGGCTGAAAGGTAGCGGCAAAGCCGCCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997891
ATGGATCCGCAGCCCGAACCCGTAAACTACATCTGCGGAGATTGTGGGCAGGAGAACACGCTGAAGCCAGGGGATGTGATTCAGTGCCGTGAATGTGGTTATCGCATCCTCTACAAGAAACGCACCCGCAGAATTGTCCAGTATGAAGCGCGCTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779306.1
MDPQPEPVNYICGDCGQENTLKPGDVIQCRECGYRILYKKRTRRIVQYEAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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