当前解析结果
SmilChr08G003344| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003344 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003344 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003344 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 34788368 - 34789201 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998386 |
|---|---|
| GeneID | 130998386 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998386 |
| 原始查询 | SmilChr08G003344 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=31; qcov=0.827; evalue=3.07e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998386 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057779788.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057779788.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057779788.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779788.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779788.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:34788396 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B76,B99 |
Chr8:34788430 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:34788439 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B4,B41,B53,B66,B71,B8,B89,C16,C70 |
Chr8:34788446 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A25,D11 |
Chr8:34788501 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 6 | A24,B75,B78,B92,C55,C56 |
Chr8:34788502 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr8:34788524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B75,C55,C56 |
Chr8:34788534 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B78,C40 |
Chr8:34788534 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B78,C40 |
Chr8:34788600 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C73 |
Chr8:34788628 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,B16 |
Chr8:34788631 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。