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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003354`

染色体: Chr08 坐标: 34947150-34949871 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003354`
名称	SmilChr08G003354
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	34947150 - 34949871 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997910`
GeneID	`130997910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997910`
原始查询	`SmilChr08G003354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
产物	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXC1
Arabidopsis	`AT2G36570` (AT2G36570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818230] identity=61.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0145900` - identity=49.7; qcov=1.1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779317.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779317.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779317.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779317.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779317.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:34947473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr8:34947556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:34947591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C23
`Chr8:34947643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:34947910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C26
`Chr8:34947917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D4
`Chr8:34948039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:34948089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr8:34948192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:34948363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D2
`Chr8:34948430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:34948441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B56,B96,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779317.1

665 aa

332

665

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 31-71 aa PF00560 LRR_1 120-142 aa PF00560 LRR_1 144-166 aa PF13855 LRR_8 144-203 aa PF00560 LRR_1 169-189 aa PF00069 Pkinase 371-631 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 371-632 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	31	71	0.0004	21.3	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	120	142	1.7e-13	48.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	144	166	1.7e-13	48.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	144	203	1.2e-11	44.9	Leucine rich repeat
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	169	189	1.7e-13	48.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	371	631	1.3e-29	104.1	Protein kinase domain
`XP_057779317.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	371	632	8e-34	117.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923334.1
AACATTTATTTTGAGAGAGAGAGAAGCCTTCTTTCTTCTTTTTCCCCTTTTCTTAGATTAATTAACTTCAGTAATCTTTTACTACATACTAATCTAGCCTTAATATAATACTTTTTGATGCTTTATTGGAAAAAATATACTCCATAAAAATAACTCTCTCTTTCATTTTGCTTTTCCTTGTACTTAATTTTGTCCTAAATAATCAATATAAATTAGGCTACTATGTTCTTTTTTCTGAATGTGTTGCTGTCCATTAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997910
ATGCACTTCCGCTCCATGCTAACAAAAATGGAGCTCAACTTCTCCTCCTTCCTCCTCACTGCAACCTCACTCTTCATCCTCGCTTCCGCCGCCAACGACACCGCCGTCCTCTCCCTCTTCCGCTCTCAGACGGATCTCCACGGTGCGCTCCTCTCCAACTGGACCTCCACCTCCAGCGCCTGCTCCGCCAAGTGGCTCGGCATCAACTGCACCAACAACCGCGTCACCGCCGTCTCCCTGCCGTCCCTCAACCTCCGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779317.1
MHFRSMLTKMELNFSSFLLTATSLFILASAANDTAVLSLFRSQTDLHGALLSNWTSTSSACSAKWLGINCTNNRVTAVSLPSLNLRGPIDALSSLDQLRLLDLRGNRLNGTLAALAQCTNLKLIYLSGNDFSGEIPPELSSLHRLRRLDLSNNNLRGPIPAQFANLSRLLTLHLQNNELSGTIPKFLDSFPHIKEVNLSNNELYGAVPKSIISRYGEGSFSGNEGLCGSSPFPKCSYTGGDQQSSTNQTVPSNPSSLPSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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