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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003366`

染色体: Chr08 坐标: 35237471-35239990 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003366`
名称	SmilChr08G003366
描述	pleiotropic drug resistance protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35237471 - 35239990 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997923`
GeneID	`130997923`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997923`
原始查询	`SmilChr08G003366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pleiotropic drug resistance protein 2-like
产物	pleiotropic drug resistance protein 2-like
Arabidopsis	`AT1G66950` (ABCG39) pleiotropic drug resistance 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843013] identity=56.1; qcov=0.987; evalue=7.9e-55; confidence=high
Rice	`Os01g0609300` (OsPDR9) - identity=46; qcov=1; evalue=1.54e-42; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01061 (ABC2_membrane); PF08370 (PDR_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997923

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057779334.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057779334.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057779334.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779334.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779334.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35237992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B140,B9,C42
`Chr8:35238052`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	B2,B37,B71,B84,B89,B9,B97,C10,C18,C2,C22,C47,C5,C51,C74,D2,D3,D6
`Chr8:35238058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C29,C49,C51,C8
`Chr8:35238059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:35238137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A25,B1,B102,B104,B105,B131,B132,B140,B17,B39,B6,B87,C12,C56,C70,C72,C76,C83,D1,D11
`Chr8:35238161`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B11,B120,B14,B67,C36
`Chr8:35238161`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B11,B120,B14,B67,C36
`Chr8:35238166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:35238378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B140,B34,B9,C42
`Chr8:35238448`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B131,B2,B37,B71,B9,B97,C10,C18,C2,C22,C47,C5,C51,C60,C65,C74,C83,D2,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779334.1

150 aa

150

ABC2_membrane

PDR_assoc

PF01061 ABC2_membrane 1-68 aa PF08370 PDR_assoc 73-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779334.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	1	68	5.5e-16	59.5	ABC-2 type transporter
`XP_057779334.1`	Pfam	`PF08370`	PDR_assoc	Family	73	138	2.5e-25	88.7	Plant PDR ABC transporter associated

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923351.1
ACTCTCCTACGTGGCATATCTAAGAATTCACAATTTAAAATCCCTGCAATTCTAGAGCTTCTAGCTTTAAAATGTACATCCCACGTGGCAATATACATCCACGTCATTTATTTTATTTAATTTATAGCAAACCCTAAGTCCTAATCTTTGGACCTCTTTCACACACACAGCCGCCCACGCCGTCCTCTGCCTCTGCGCGAATCCAGTCGCCCACCTCCCCACCAACCCCCGCCAGACGCCGTTCTGCTGCCGCGATTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997923
ATGGCTCTCTCCCTCTTCCGTTTCATTGCTGTAGTAGGAAGAACTCAAGTCGTTGCAAACACATTTGGAACTTTCGCCTTGCTGTTGGTGTTTGTGTTGGCAGGCTTTGTTGTTGCAAAGGATGATATCCAAGATTGGATGATATGGGGTTACTACATCTCTCCTATGATGTATGGACAGAACGCAATCGCCGTTAATGAGTTCCTCTATGAGAGATGGAATGCAACTGCGCCTGCTAATTCATGTGAGTCAACTGTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779334.1
MALSLFRFIAVVGRTQVVANTFGTFALLLVFVLAGFVVAKDDIQDWMIWGYYISPMMYGQNAIAVNEFLYERWNATAPANSCESTVGKTLLKDRCLFTTESWYWICIIALFTFSLLFNVLFVAALTYLNPLGDNKAIISDENEDSKNKKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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