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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003369`

染色体: Chr08 坐标: 35304985-35305614 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003369`
名称	SmilChr08G003369
描述	uncharacterized SmilChr08G003369
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35304985 - 35305614 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998391`
GeneID	`130998391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998391`
原始查询	`SmilChr08G003369`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0351414` - identity=23.6; qcov=1.01; evalue=5.48e-09; confidence=weak
GO	GO:0003906 (DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity); GO:0008311 (double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779792.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779792.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779792.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779792.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35305161`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A19,A20,A5,B104,B112,B12,B123,B132,B3,B42,B43,B48,B65,C15,C23,C4,C53,C54,C59,C82,D6,D8
`Chr8:35305238`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A23,A5,B112,B114,B119,B126,B138,B3,B40,B42,B43,B5,B63,B79,B81,B82,B88,B9,B93,C1,C15,C18,C19,C2,C3,C35,C43,C45,C47,C50,C58,C61,C68,C71,C77,C86,D5
`Chr8:35305275`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,A15,B18,B59,B80,B97,C36,C80
`Chr8:35305325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B139,B17
`Chr8:35305330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr8:35305330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:35305367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C60
`Chr8:35305367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:35305415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C72
`Chr8:35305416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr8:35305444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B38,B39,C72
`Chr8:35305465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779792.1

209 aa

104

209

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 2-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779792.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	2	206	8.5e-12	46.0	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923809.1
ATGGTATCTTATAACATTAGAGGGCTTGGGAGCAAGATCAAAAAGAGAGAGGTTAGGGAGTTAATACAGAAACAGAAGATTGATTTCTGCTTTTTACAGGAAACAAAAATGGAGAATATTAATGAGTTCGATCTGAAAAGCATTTGGGGGACTGATTCTGTTGGATTTGCGAGGCGTCAAGCAGATGGAAGATCAGGGGGAATTCTCTCAATGTGGAACCCTGCTATCTTCTCTAGCTCCAGTCAATGGGATATTTCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998391
ATGGTATCTTATAACATTAGAGGGCTTGGGAGCAAGATCAAAAAGAGAGAGGTTAGGGAGTTAATACAGAAACAGAAGATTGATTTCTGCTTTTTACAGGAAACAAAAATGGAGAATATTAATGAGTTCGATCTGAAAAGCATTTGGGGGACTGATTCTGTTGGATTTGCGAGGCGTCAAGCAGATGGAAGATCAGGGGGAATTCTCTCAATGTGGAACCCTGCTATCTTCTCTAGCTCCAGTCAATGGGATATTTCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779792.1
MVSYNIRGLGSKIKKREVRELIQKQKIDFCFLQETKMENINEFDLKSIWGTDSVGFARRQADGRSGGILSMWNPAIFSSSSQWDISGALIVNGRWAAGNINGCFINVYAPQNLIDKEALWDYLGGVVCQNRVSPICIAGDFNSIRFGNERVGRGSQFSTRDMQAFDNFIRANDLVEIRLQGRTFTWYQPNGQCKSKLDRFLVNDKWLEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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