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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003374`

染色体: Chr08 坐标: 35343444-35344747 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003374`
名称	SmilChr08G003374
描述	uncharacterized SmilChr08G003374
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35343444 - 35344747 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998392`
GeneID	`130998392`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998392`
原始查询	`SmilChr08G003374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=38.5; qcov=0.833; evalue=6.57e-70; confidence=medium
Rice	`Os05g0311600` - identity=59.1; qcov=0.271; evalue=1.29e-37; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998392

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779793.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779793.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779793.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779793.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35343449`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A10,A5,B114,B122,B23,B47,B48,B66,B94,C10,C37,C4
`Chr8:35343451`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A10,A5,B114,B122,B23,B47,B48,B66,B94,C10,C37,C4
`Chr8:35343570`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A6,B10,B100,B103,B106,B121,B134,B34,B37,B41,B45,B5,B61,B73,B83,C12,C20,C28,C3,C51,C56,C78,C81,D2
`Chr8:35343580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	142	A1,A11,A13,A14,A15,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,B10,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B112,B114,B117,B120,B121,B122,B123,B125,B131,B132,B134,B135,B136,B14,B15,B16,B18,B2,B20,B22,B23,B25,B28,B33,B34,B35,B37,B39,B4,B41,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B58,B6,B61,B65,B66,B69,B72,B73,B74,B77,B78,B8,B80,B83,B84,B85,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B98,B99,C10,C12,C17,C20,C21,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C45,C46,C47,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C76,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D10,D11,D3,D5
`Chr8:35343586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr8:35343612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B103,B41,B84,C10
`Chr8:35343647`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A1,A10,A19,A22,A24,A3,A5,B105,B110,B112,B120,B128,B16,B18,B23,B35,B51,B6,B66,B69,B70,B91,B97,B99,C36,C37,C50,C54,C77
`Chr8:35343667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:35343679`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	B106,B107,B114,B124,B128,B129,B130,B136,B15,B21,B23,B25,B29,B38,B39,B4,B59,B65,B66,B68,B74,B75,B76,B86,B9,B95,B98,C16,C23,C24,C27,C28,C40,C41,C42,C48,C50,C65,C7,C72,C73,C85,D9
`Chr8:35343688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A21,B19,C63
`Chr8:35343688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B19,C63
`Chr8:35343701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779793.1

406 aa

203

406

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 164-402 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 306-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779793.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	164	402	1.3e-75	254.7	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057779793.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	306	399	1.3e-07	32.1	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923810.1
ATGAAGTATAAAACACTACATTCGTTTTTCAATGACAACAAGAAACGCCAAAGGGTTGTTGAGGAGAGTTCAACTTCTCCTATTTTAGAAACTTCAATGCTTGATATGGATAATAATGTTGCTTCTGAAATGATCACTCCGGTGACTCCACCAACAAATATTATTGAGCAGTCTTCTCAAAAAGAGGTACAAAAGCTTGATCCCAATTTTAATAATTTTCATATAGAACGAGATCTCGGATTGCGTATGTCTATATGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998392
ATGAAGTATAAAACACTACATTCGTTTTTCAATGACAACAAGAAACGCCAAAGGGTTGTTGAGGAGAGTTCAACTTCTCCTATTTTAGAAACTTCAATGCTTGATATGGATAATAATGTTGCTTCTGAAATGATCACTCCGGTGACTCCACCAACAAATATTATTGAGCAGTCTTCTCAAAAAGAGGTACAAAAGCTTGATCCCAATTTTAATAATTTTCATATAGAACGAGATCTCGGATTGCGTATGTCTATATGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779793.1
MKYKTLHSFFNDNKKRQRVVEESSTSPILETSMLDMDNNVASEMITPVTPPTNIIEQSSQKEVQKLDPNFNNFHIERDLGLRMSIWSYSVDKRDEIRRAYLTMGPYQGIPEKSSEYMDKNRRKFVPAWYKKFPDWLEYSPIKNAAYCLHRFLFVKPSAHPWANAFNVDGFQNWKKVSNGDKCSFLIHERKCPNSSHKKAVKQSLDLMNSLQHIERVIDKQSSEMVEKNRLRLKVSIDVAKLCAFQGIAFRARDECPDSSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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