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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003375`

染色体: Chr08 坐标: 35355907-35361726 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003375`
名称	SmilChr08G003375
描述	delta(14)-sterol reductase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35355907 - 35361726 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997928`
GeneID	`130997928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997928`
原始查询	`SmilChr08G003375`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	delta(14)-sterol reductase-like
产物	delta(14)-sterol reductase-like
Arabidopsis	`AT3G52940` (FK) Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824460] identity=72.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0565600` - identity=67.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0016126 (sterol biosynthetic process); GO:0050613 (Delta14-sterol reductase activity)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01222 (ERG4_ERG24); PF06966 (DUF1295)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779342.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057779342.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779342.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779342.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35357379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:35357471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:35357870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:35360610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:35360862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C26
`Chr8:35360863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C26
`Chr8:35361487`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A18,A23,A5,A7,B112,B113,B114,B119,B12,B120,B126,B130,B132,B138,B3,B31,B40,B42,B43,B5,B51,B63,B79,B81,B82,B88,B9,B93,C1,C10,C15,C18,C19,C2,C28,C3,C32,C40,C43,C45,C47,C50,C58,C59,C61,C68,C7,C70,C71,C77,C83,C85,C86,D5,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779342.1

369 aa

184

369

ERG4_ERG24

DUF1295

PF01222 ERG4_ERG24 12-369 aa PF06966 DUF1295 206-315 aa

XP_057779343.1

369 aa

184

369

ERG4_ERG24

DUF1295

PF01222 ERG4_ERG24 12-369 aa PF06966 DUF1295 206-315 aa

XP_057779344.1

367 aa

184

367

ERG4_ERG24

DUF1295

PF01222 ERG4_ERG24 12-367 aa PF06966 DUF1295 204-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779342.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	12	369	8.6e-90	302.3	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057779342.1`	Pfam	`PF06966`	DUF1295	Family	206	315	5.7e-07	30.0	Protein of unknown function (DUF1295)
`XP_057779343.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	12	369	8.6e-90	302.3	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057779343.1`	Pfam	`PF06966`	DUF1295	Family	206	315	5.7e-07	30.0	Protein of unknown function (DUF1295)
`XP_057779344.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	12	367	6.9e-86	289.4	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057779344.1`	Pfam	`PF06966`	DUF1295	Family	204	313	5.6e-07	30.0	Protein of unknown function (DUF1295)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923361.1
ATAAATCTAGGGATAGAAATTGAATTAAGCATCGCACACCAGACACCACGGGAGCCCCTCGGTCGCTGCTTCACCCGGCGCCTCCACTCGCGGCGAGCCCGTCCGCCACCGGCCCACCACCGTCAGTTGCCCCGCCTCCATTTGCGGCACCACCGCCGCCTCAGCCACCACCACCTCCGGCCTCCGGCCCCGCCCCGCCCCTGCCTCTGCCGAAAGCCGCCTCAGCTATCATCTGTCCTAAAGCGGAGATAGTGATTGAA...

XM_057923360.1
TAAATCTAGGGATAGAAATTGAATTAAGCATCGCACACCAGACACCACGGGAGCCCCTCGGTCGCTGCTTCACCCGGCGCCTCCACTCGCGGCGAGCCCGTCCGCCACCGGCCCACCACCGTCAGTTGCCCCGCCTCCATTTGCGGCACCACCGCCGCCTCAGCCACCACCACCTCCGGCCTCCGGCCCCGCCCCGCCCCTGCCTCTGCCGAAAGCCGCCTCAGCTATCATCTGCAGTCCTAAAGCGGAGATAGTGATTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997928
ATGAATCTCGGTCTGCTTCTCCTCGCCTTCACTCCTTCATGGACTTCGGTCTCTATGCTGCTCGGATATGTCACTTATCTGGTGATTGTTGGATCCATTTTGCCGGGTAAAATTGTACCTGGAGTGACTTTATCAGATGGAACTCGCCTGCATTACCGTTGTAATGGTTTATTATTGCTTGTTTTATTGGTTTTTCTGCTTGGAATTGGTGGCTGGATGGATCTCTTATCACCTACGGCTATTGCTGATAGAGGTCTCGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057779342.1
MNLGLLLLAFTPSWTSVSMLLGYVTYLVIVGSILPGKIVPGVTLSDGTRLHYRCNGLLLLVLLVFLLGIGGWMDLLSPTAIADRGLELLSATLVFSVLVTNLLYMVGCRSRDQSSSFKPHTTGNLIEDWWFGIQLNPQFMGLDLKFYFVRAGMLGWLLINLSVLVKCIQESNLSQSMILYQLFCVIYIMDYFVHEEYMTSTWDIIAERLGFMLVFGDIVWIPFTFSIQGWWLLRNKVELTTAAIIANCLVFFMGYLIFRG...

XP_057779343.1
MNLGLLLLAFTPSWTSVSMLLGYVTYLVIVGSILPGKIVPGVTLSDGTRLHYRCNGLLLLVLLVFLLGIGGWMDLLSPTAIADRGLELLSATLVFSVLVTNLLYMVGCRSRDQSSSFKPHTTGNLIEDWWFGIQLNPQFMGLDLKFYFVRAGMLGWLLINLSVLVKCIQESNLSQSMILYQLFCVIYIMDYFVHEEYMTSTWDIIAERLGFMLVFGDIVWIPFTFSIQGWWLLRNKVELTTAAIIANCLVFFMGYLIFRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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