当前解析结果
SmilChr08G003376| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003376 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003376 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003376 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 35368587 - 35369444 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998393 |
|---|---|
| GeneID | 130998393 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998393 |
| 原始查询 | SmilChr08G003376 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=29; qcov=0.919; evalue=2.82e-27; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998393 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779795.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057779795.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057779795.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057779795.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779795.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:35368616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B68,B88,C32,C80 |
Chr8:35368641 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,B139,C75 |
Chr8:35368659 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr8:35368683 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,C82 |
Chr8:35368781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr8:35368846 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr8:35368875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C42 |
Chr8:35368893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B102,B68 |
Chr8:35368893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,B68 |
Chr8:35369073 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,C26,D6 |
Chr8:35369083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr8:35369108 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B121,C11,C41,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。