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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003381`

染色体: Chr08 坐标: 35490242-35492382 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003381`
名称	SmilChr08G003381
描述	uncharacterized SmilChr08G003381
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35490242 - 35492382 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998395`
GeneID	`130998395`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998395`
原始查询	`SmilChr08G003381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998395

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779797.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057779797.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779797.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779797.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779797.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35490249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B9,C26
`Chr8:35490268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B59,B82
`Chr8:35490286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C75
`Chr8:35490295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A18,A20,A5,B112,B115,B16,B27,B32,B35,B51,B88,C19,C25,C3,C73,C76,C84,D6
`Chr8:35490298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:35490300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:35490305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B100,B128
`Chr8:35490326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:35490328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	79	A18,A20,A24,A5,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B112,B115,B119,B127,B13,B134,B135,B138,B15,B16,B21,B22,B26,B27,B29,B32,B33,B36,B38,B39,B4,B45,B47,B57,B60,B61,B62,B68,B72,B76,B85,B88,B9,B90,B92,B94,B96,C1,C12,C19,C21,C24,C27,C29,C3,C31,C37,C38,C40,C49,C5,C50,C51,C54,C56,C60,C63,C64,C66,C70,C73,C74,C76,C8,C84,C86,D1,D11,D6
`Chr8:35490330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B83
`Chr8:35490342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B2,B35,B59,B82
`Chr8:35490344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779797.1

667 aa

334

667

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 359-497 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779797.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	359	497	2.5e-18	67.3	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923814.1
ATGGAAAAAAATCCTGATCTTTCTTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACATTTTGGATCACCGAAAAGTGCAGCCAAACATTTCTCCGCTCTCCCTCAGATGGCCGAGTCAGCTGAAAAACCCTCGTCTTCTCGAACTCCGGTGGAAGTCCCAAGAGAAACCTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGCACCACTGAATTGTCTGTTGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTTTGCAAATGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998395
ATGGAAAAAAATCCTGATCTTTCTTCTCTCATCAAGAGTCTGATCCAACATTTTGGATCACCGAAAAGTGCAGCCAAACATTTCTCCGCTCTCCCTCAGATGGCCGAGTCAGCTGAAAAACCCTCGTCTTCTCGAACTCCGGTGGAAGTCCCAAGAGAAACCTTTCCTCTAGCTCCTTCTCCAAAAGGCTCTCCGAAGAGAAGCACCACTGAATTGTCTGTTGGGGCTGATGTTGATCCTGTCTCTTTGCAAATGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779797.1
MEKNPDLSSLIKSLIQHFGSPKSAAKHFSALPQMAESAEKPSSSRTPVEVPRETFPLAPSPKGSPKRSTTELSVGADVDPVSLQMVETPINPEPISTVKLTKISRRGKLLYKASLEESIPSSKEESSHASQDTSLERIGEIAKEAQLDLASQPGSDVDKASVVAEEECAAGDQPTSMDVDDPEKIPNVDQDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKAGVASLKRSSRSKSTRVIPSTLNLPSREDSDVGPTSLPPVPKPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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