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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003386`

染色体: Chr08 坐标: 35591050-35592995 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003386`
名称	SmilChr08G003386
描述	uncharacterized SmilChr08G003386
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35591050 - 35592995 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998399`
GeneID	`130998399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998399`
原始查询	`SmilChr08G003386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009]; symbol=AT3G17450; hit=AT3G17450; species=arabidopsis; confidence=low
产物	hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009]; symbol=AT3G17450; hit=AT3G17450; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=32.4; qcov=1.05; evalue=1.18e-103; confidence=low
Rice	`Os01g0379800` - identity=34.5; qcov=1; evalue=4.23e-100; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF26664 (zf-BED_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779801.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779801.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779801.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779801.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35591056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B23,B86,C14,C62
`Chr8:35591071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B65,D6
`Chr8:35591094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B114,B5
`Chr8:35591108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B28,B70,B82,C78
`Chr8:35591115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B65,B69,D10,D6
`Chr8:35591115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B65,B69,D10,D6
`Chr8:35591297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B31
`Chr8:35591336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B107,B65,D6
`Chr8:35591336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B65,D6
`Chr8:35591348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,C3,C8
`Chr8:35591350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C55
`Chr8:35591396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B2,B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779801.1

592 aa

296

592

zf-BED_2

DUF659

PF26664 zf-BED_2 23-66 aa PF04937 DUF659 191-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779801.1`	Pfam	`PF26664`	zf-BED_2	Domain	23	66	5.5e-11	42.8	BED-like zinc finger
`XP_057779801.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	191	342	5e-59	198.9	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923818.1
ATGAGTCGAAAGGATCCAGCCTGGAAGTACGCGAAAGAAATTCCTGTACCAGGAAAATTATATAAATATCTTGAATGCAACTTTTGCCAACAAGATATTAAGGGTGGAGTTGGTAGAATGAAGGACCATCTTGCTGCTACGCATAAGAACGTGAGGGCTTGCCCAAAAGTTCCTGATGAAGTGAAAGAAGAAATTTTGAAGTACTTGAAGAAGGGGACAACAGACAAAGAAAAACGCCAGGACCAATTCAACGATATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998399
ATGAGTCGAAAGGATCCAGCCTGGAAGTACGCGAAAGAAATTCCTGTACCAGGAAAATTATATAAATATCTTGAATGCAACTTTTGCCAACAAGATATTAAGGGTGGAGTTGGTAGAATGAAGGACCATCTTGCTGCTACGCATAAGAACGTGAGGGCTTGCCCAAAAGTTCCTGATGAAGTGAAAGAAGAAATTTTGAAGTACTTGAAGAAGGGGACAACAGACAAAGAAAAACGCCAGGACCAATTCAACGATATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779801.1
MSRKDPAWKYAKEIPVPGKLYKYLECNFCQQDIKGGVGRMKDHLAATHKNVRACPKVPDEVKEEILKYLKKGTTDKEKRQDQFNDMVESGAYFHDSSNPIHGDDGDMRSIRGPMDKYLVHVDDENIDGQEKHAANPPQDMSQHIKEARKQVAMDIGRFFFENGISFNCIESPAFVNMCRSIGLYGKGLKVPSRQELSTWILREEVKTTDVIVEDVKRSWIQTGVSILSDGWKDMRGRSLINFLVNNPHGTVFLRSVDASD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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