当前解析结果
SmilChr08G003392| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003392 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003392 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003392 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 35703074 - 35705513 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998400 |
|---|---|
| GeneID | 130998400 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998400 |
| 原始查询 | SmilChr08G003392 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998400 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057779802.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057779802.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779802.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779802.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779802.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:35703089 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B61,D2 |
Chr8:35703090 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B38,C15 |
Chr8:35703104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr8:35703112 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B13,B71,B99,C22,C41,C58,C71 |
Chr8:35703119 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr8:35703147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B43,C11,C7 |
Chr8:35703151 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B2,B73 |
Chr8:35703153 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B137,C18,C54,C86 |
Chr8:35703157 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B127,B69,C6 |
Chr8:35703164 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B12,C2 |
Chr8:35703172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,C8 |
Chr8:35703184 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B43,C78 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。