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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003395`

染色体: Chr08 坐标: 35779422-35780208 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003395`
名称	SmilChr08G003395
描述	60S ribosomal protein L27a-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35779422 - 35780208 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997942`
GeneID	`130997942`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997942`
原始查询	`SmilChr08G003395`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L27a-3
产物	60S ribosomal protein L27a-3
Arabidopsis	`AT1G70600` (AT1G70600) Ribosomal protein L18e/L15 superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843397] identity=87; qcov=1; evalue=2.04e-92; confidence=high
Rice	`Os03g0408300` (OSJNBa0030J19.9) - identity=80.8; qcov=1; evalue=4.54e-84; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00828 (Ribosomal_L27A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997942

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779361.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779361.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35779622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B47,B55,B89
`Chr8:35779681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B11,B121,C26
`Chr8:35779684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:35779805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779361.1

146 aa

146

Ribosomal_L27A

PF00828 Ribosomal_L27A 72-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779361.1`	Pfam	`PF00828`	Ribosomal_L27A	Domain	72	143	3.7e-17	63.2	Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923378.1
TTCGCCAAAAATCAATTGTCCTCAAATATAATCTATACCTAAAATCACACTCCACCACACCTCACCCACACCCACACGCATCCCATATATAAACTCCTCAAAACCCTAGTTTTCATTTCCTCAGTGCGGCGCCGATCCGTTTCCCCTCCTTTCGCCATTCCACCCCTCTCCCCACCGCAAAAATGACCACCAGATTCAAGAAGAACCGCAAGAAGCGCGGCCACGTTAGCGCCGGTCACGGCCGTATCGGGAAGCACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997942
ATGACCACCAGATTCAAGAAGAACCGCAAGAAGCGCGGCCACGTTAGCGCCGGTCACGGCCGTATCGGGAAGCACCGCAAGCATCCCGGAGGTCGCGGAAACGCCGGAGGCATGCACCACCACCGCATCCTCTTCGACAAGTACCATCCCGGTTACTTCGGCAAGGTCGGTATGCGCTACTTCCACAAGCTGCGCAACAAGTTCTTCTGCCCCACCGTCAACATCGACCGTCTCTGGGCGTTGGTGCCGCAGGAGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779361.1
MTTRFKKNRKKRGHVSAGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRILFDKYHPGYFGKVGMRYFHKLRNKFFCPTVNIDRLWALVPQEVKDKASKDNAPVIDVTQFGYFKVLGKGLLPADKPVVVKAKLVSKNAEKKIKEAGGAVVLTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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