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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003397`

染色体: Chr08 坐标: 35827192-35829665 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003397`
名称	SmilChr08G003397
描述	heat stress transcription factor A-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35827192 - 35829665 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997944`
GeneID	`130997944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997944`
原始查询	`SmilChr08G003397`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heat stress transcription factor A-3-like
产物	heat stress transcription factor A-3-like
Arabidopsis	`AT5G03720` (HSFA3) heat shock transcription factor A3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831749] identity=37.2; qcov=0.714; evalue=7.93e-30; confidence=medium
Rice	`Os03g0795900` (HSFA2E) - identity=43.6; qcov=0.464; evalue=4.27e-26; confidence=medium
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779366.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779366.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779366.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779366.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35827377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B137,B87
`Chr8:35827452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B137
`Chr8:35827498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B37,C82,D4
`Chr8:35827857`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	171	A1,A14,A15,A16,A18,A2,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A8,B10,B101,B102,B104,B106,B107,B108,B11,B110,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B122,B125,B126,B128,B13,B130,B132,B133,B134,B136,B138,B14,B140,B15,B16,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B40,B42,B43,B44,B47,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B67,B68,B70,B72,B74,B75,B78,B79,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B95,B96,B97,B98,C1,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C3,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C56,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C77,C79,C8,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr8:35827914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A2,B1,B31,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923383.1
TTGTGGTTCTTGCAATTGTGCCTAGTGTATGTTGTATTGGTTACAACTTTCCAGCTTGGTTGTCTTGTCCAAAGCAACTACATAATAGTGACATTTAAGTGATAAACGGCATTATTCCCTCATTGGTTAAACCCGGCCGTTATTTTTCTTCTGCTTGCTTCTCACACTAAGAAGCGACCAAACAATCTTGTACTTGGACGATTCTATATGATCTTGTAGACGGAGCGACGGGAAGCTAAGCCGCCTCCTACAACACCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997944
ATGAAAAGCATTCTACACTTCTGGGGATTTCGCAAAATAGACACGGATAAATGGGAGTTCACAAATGGAGGATTTGTACGAGGGCAGAGGCATCTACTGAAAACAATACAAAGACGGAAATCACACAATCCACAGCAGCAGCTTGAGGGATCATCTAATGCATTGGAAGGTGACATTAAAGAGTTGAGGAGAGAGAGAAGGTTGATGACGGAGGAGGTGATGGGATTGCAGCACGAGCAGCGTTGTACGGTTCAGCACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779366.1
MKSILHFWGFRKIDTDKWEFTNGGFVRGQRHLLKTIQRRKSHNPQQQLEGSSNALEGDIKELRRERRLMTEEVMGLQHEQRCTVQHMGVVEEKLEAAETRHKQMISFLATMLHSQTIPSSSRTMRRFVKHQPQLCNSDPPSLDAQDLILYTADKGDSVAMNPADQRPISSPQNVVVENGVPGFLTAEDAGLEAGHPWEGYVSDYDAPHLGVGGEFLDVSEIGSMQLQGSSGIKNWLDEESPVNYIYMDPSIK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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