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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003406`

染色体: Chr08 坐标: 35977635-35980807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003406`
名称	SmilChr08G003406
描述	trihelix transcription factor PTL
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	35977635 - 35980807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997953`
GeneID	`130997953`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997953`
原始查询	`SmilChr08G003406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor PTL
产物	trihelix transcription factor PTL
Arabidopsis	`AT5G03680` (PTL) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831757] identity=45.5; qcov=0.976; evalue=3.6e-111; confidence=high
Rice	`Os04g0541100` (GT-2) - identity=46.1; qcov=0.19; evalue=7.2e-18; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13837 (Myb_DNA-bind_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997953

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779372.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779372.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779372.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779372.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:35978140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr8:35978298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr8:35978474`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B114,B15,B56,B59,D9
`Chr8:35978474`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B114,B15,B56,B59,D9
`Chr8:35978475`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B114,B15,B56,B59,D9
`Chr8:35978475`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B114,B15,B56,B59,D9
`Chr8:35978494`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B114,B15,B56,D9
`Chr8:35978494`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B114,B15,B56,D9
`Chr8:35978497`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B114,B15,B56,D9
`Chr8:35978497`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B114,B15,B56,D9
`Chr8:35978506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B56,D9
`Chr8:35978569`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779372.1

468 aa

234

468

Myb_DNA-bind_4

PF13837 Myb_DNA-bind_4 85-171 aa PF13837 Myb_DNA-bind_4 340-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779372.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	85	171	1.8e-30	105.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057779372.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	340	407	1.8e-30	105.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923389.1
AACACAATCGCCATATTCAATTCATCTCTCACAACTGTACACAATCAATCCCATGCCATATAGAGAGAGACAGAGCTAGAGAGATGGAGAGGGGCTCCCGCTCATGAATTGTGGGTTTTTGAAGCAGACTGTTGAGAAATTAAGAGAGAGAAGAAGAAGAAGAAAGAGTCAAAAGGGCATTCACTGTGTCTCATTTTTTGACATATGTCCTCACTTTATTCGCCCTTAATTGCGTATATGAGTACACACTACCTTATACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997953
ATGGAAGATCAATACGGCATGGCCGATCTGCGCCAGTACATCAGCAGCCGCCCTTTATTCCCCCCAATCCCGCCGCCGCCGGACTTGCTATCCGCCCACCGCGGCGGCCTCAACCCCTACGACATGCTCATCTTCCGCTCAGATTCCGTCGCCACCGCTAACAACAACAACGCGGGGGGCGCCGCCGCCTCCAGCAGCGCCGGCTTCGGGGGCTTCGAGAGCGGCCTCAACGGCGGCGACAGCGGCGCGGGGAGATGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779372.1
MEDQYGMADLRQYISSRPLFPPIPPPPDLLSAHRGGLNPYDMLIFRSDSVATANNNNAGGAAASSSAGFGGFESGLNGGDSGAGRWPRQETLTLLEIRSRLDPKFKEANQKGPLWDEVSRIMSEEHGYNRSGKKCREKFENLYKYYKKTKEGKAGRQDGKHYRFFRQLEALYGGEPHTTSASMSEAAGSYHVSFPNKSALLSAPKLSDTSLSLSNYSEAETSSSDDSDEGKMMIKKRGGWKVKIREFIDVQMKKLMDKQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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