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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003413`

染色体: Chr08 坐标: 36254074-36256187 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003413`
名称	SmilChr08G003413
描述	uncharacterized SmilChr08G003413
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36254074 - 36256187 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997959`
GeneID	`130997959`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997959`
原始查询	`SmilChr08G003413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcriptional activator (DUF662) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824458]; symbol=AT3G52920; hit=AT3G52920; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transcriptional activator (DUF662) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824458]; symbol=AT3G52920; hit=AT3G52920; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G52920` (AT3G52920) transcriptional activator (DUF662) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824458] identity=72; qcov=0.942; evalue=4.24e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0408600` - identity=68.2; qcov=0.772; evalue=1.13e-60; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04949 (Transcrip_act)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997959

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779376.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057779377.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779376.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057779377.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779376.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36254394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B41,B61,B72,C14
`Chr8:36254417`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B104,B11,B41,B61,B72,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779376.1

178 aa

178

Transcrip_act

PF04949 Transcrip_act 20-146 aa

XP_057779377.1

171 aa

171

Transcrip_act

PF04949 Transcrip_act 20-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779376.1`	Pfam	`PF04949`	Transcrip_act	Family	20	146	1.7e-62	210.6	Transcriptional activator
`XP_057779377.1`	Pfam	`PF04949`	Transcrip_act	Family	20	167	5.1e-74	248.0	Transcriptional activator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923394.1
AGAAATGAGGTAGAATAATTTGAAATAGTGGGTCATAAAAGCCATAAGCTAAGCTGGCTTTCCTTACTTTAAACATAAGAGAGAGAGACCCCTTCATTCCACCCTTGTTCATAAGCACCTGCAAACAGGAACCCAAGAGAAAAACCTCTCTCTCTCTCATCATTCCAAAAGCAAAAGCAAAAGCGAATTAAAGGGCGAGAGAAAGAAGCCCCCCAAGGCTGAAAAAAGAGCAAAAGAGGCCATCCGCAAGAGATAATAAA...

XM_057923393.1
AGAAATGAGGTAGAATAATTTGAAATAGTGGGTCATAAAAGCCATAAGCTAAGCTGGCTTTCCTTACTTTAAACATAAGAGAGAGAGACCCCTTCATTCCACCCTTGTTCATAAGCACCTGCAAACAGGAACCCAAGAGAAAAACCTCTCTCTCTCTCATCATTCCAAAAGCAAAAGCAAAAGCGAATTAAAGGGCGAGAGAAAGAAGCCCCCCAAGGCTGAAAAAAGAGCAAAAGAGGCCATCCGCAAGAGATAATAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997959
ATGATGCAGACGCAGAGGACGCTTGAAAACCAGCAATCTATGCAGTCGGGCCAGATTTCTGGGAGCCTCAGCTTCAACGGCACTCTCTCCAAGGAAGACGAGGAGATGTCCAAATCCGCTCTCTCCACTTTCAGGGCCAAGGAGGAGGAAATTGAGAAGAAGAAGATGGAAGTTAAGGAGAAAGTTCAAGCTCAGCTCGGCCGAATTGAAGAAGAAACCAAGCGTTTGGCCGTCATCCGTGAGGAATTAGATGCCCTCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779376.1
MMQTQRTLENQQSMQSGQISGSLSFNGTLSKEDEEMSKSALSTFRAKEEEIEKKKMEVKEKVQAQLGRIEEETKRLAVIREELDALSDPMKKEVSFVRKKIDSVNKELKPLGQTCQKKEREYKEALEAFNEKNKEKVQLITKLMEVRAKLILLIHSNHTLNARELKLITSYVFYSAGE

XP_057779377.1
MMQTQRTLENQQSMQSGQISGSLSFNGTLSKEDEEMSKSALSTFRAKEEEIEKKKMEVKEKVQAQLGRIEEETKRLAVIREELDALSDPMKKEVSFVRKKIDSVNKELKPLGQTCQKKEREYKEALEAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERMRLKKLEELSKNIETIRIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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