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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003414`

染色体: Chr08 坐标: 36285419-36287444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003414`
名称	SmilChr08G003414
描述	uncharacterized SmilChr08G003414
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	36285419 - 36287444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997960`
GeneID	`130997960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997960`
原始查询	`SmilChr08G003414`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transcription factor TFIIE, alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838581]; symbol=AT1G03280; hit=AT1G03280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Transcription factor TFIIE, alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838581]; symbol=AT1G03280; hit=AT1G03280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G03280` (AT1G03280) Transcription factor TFIIE, alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838581] identity=52.1; qcov=0.471; evalue=4.06e-09; confidence=low
Rice	`Os08g0343300` - identity=54.4; qcov=0.451; evalue=3.9e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779378.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779378.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779378.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779378.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:36285757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B134,B138,C23
`Chr8:36285814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C11
`Chr8:36285929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr8:36285930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr8:36286183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B44,B85,C24
`Chr8:36286247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B33,B46,C17,C60
`Chr8:36286249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B129,B134,B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923395.1
GGTTTGATTAATGAAAAACTAAAAAAAAAGCTTGATTAATTAGAAAACATTGTTGACATCTATCAATTCTATAAAGCAATACATATTCCAGCTCCCATATTATTTCTCTCTCCTACATGGCACACTCACAATTCAAGATTTTCACCTCTCTCAATTCTACACTTTCTGCCTTCAAATTCAACAATTGTTTTCTCTCGCCCTCATCTCCTTCAATCACCGAAACTATAGCCACACATTCATGAATCACCCACGCAATTCGT...

XM_057923396.1
CTCCATGTTGTTAATTTCCTCCCTGATTTCCCCTTAAGCAAATAAGTTTGGACGCCGACGCCGGCGAGAGAAAAACAGCCATTCGCTGACATTTTCAGTTTCAAGGGATGAGAGTGTTATTGAATGAGAACATATTGGAGAATGATCATGCCTATGTTTAAATATGAAAGACGAAATGACATATTTCTGTTGAACACCACTTTTTATCCAAATTTACTGGAGAACTATTTTCACGTATATGGAGACTCATGAAAAACAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997960
ATGGTTTTCATTGTCTATAAGTACTTTACAACAATCGCCAGGCTAAAAGACGTCAGTGGACTAAGGAAGAAAGATTTTGCTAGGGACTTGAAACGCAACTCCCTGAGATTCTTCGAAGAAGAAATGCTGGTCACTCGTGACCACCACAAGGAGACCTCCAAAAGTGCAAAGATGTTTAGTGCTGCAGCAATGGATGTGTTTCTCAATCTCTGGAGCTCAACACGCCAACTGCTCCAGTCTCATGGTCTTCACGGCAGCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779378.1
MVFIVYKYFTTIARLKDVSGLRKKDFARDLKRNSLRFFEEEMLVTRDHHKETSKSAKMFSAAAMDVFLNLWSSTRQLLQSHGLHGSAQSPQWTYPEGAPPLL

XP_057779379.1
MVFIVYKYFTTIARLKDVSGLRKKDFARDLKRNSLRFFEEEMLVTRDHHKETSKSAKMFSAAAMDVFLNLWSSTRQLLQSHGLHGSAQSPQWTYPEGAPPLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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