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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003466`

染色体: Chr08 坐标: 37286043-37287059 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003466`
名称	SmilChr08G003466
描述	uncharacterized SmilChr08G003466
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37286043 - 37287059 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998423`
GeneID	`130998423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998423`
原始查询	`SmilChr08G003466`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724]; symbol=AT1G21280; hit=AT1G21280; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G21280` (AT1G21280) Copia-like polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838724] identity=31; qcov=0.472; evalue=1.61e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779821.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779821.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779821.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779821.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779821.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37286047`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A10,A25,B103,B109,B113,B120,B122,B123,B125,B138,B15,B16,B2,B28,B34,B46,B5,B54,B6,B83,B85,B92,C10,C18,C20,C21,C22,C23,C3,C36,C37,C39,C53,C73,C84,D10,D11,D2
`Chr8:37286049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr8:37286058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B129,B29,B50,C29
`Chr8:37286062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C82
`Chr8:37286069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:37286086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37286112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:37286113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:37286129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B22,C79
`Chr8:37286169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C57
`Chr8:37286175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A16,A18,A2,A3,A5,A6,B105,B108,B118,B126,B127,B131,B136,B137,B138,B22,B23,B26,B29,B3,B46,B47,B50,B6,B62,B64,B70,B89,B91,C16,C26,C27,C36,C4,C46,C47,C48,C52,C59,C60,C63,C64,C66,C75,C84,C85,C87,C9,D2,D7
`Chr8:37286177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B35,C36,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923838.1
ATGGTAGTTTCTTGGCTGCGTAACTCCGTTAATTCTGAAATTAGCGCGAGCATCATGTATATTGATGACGCGCATCTGATCTGGAACGATCTTAGAGATCGTTTTTCTCAAGGAAATATGGCTCGTGTTTGCCAGCTGAAACAACAACTTCTTAATCTGAGGCAGGGATCTGAAGATGTAGGCTTAAAGAAATGGAGCAAGTACCAGATGCAAGAATGCTCGATGCAATTTCTCATCGGTTTGAATCTCACATTTGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998423
ATGGTAGTTTCTTGGCTGCGTAACTCCGTTAATTCTGAAATTAGCGCGAGCATCATGTATATTGATGACGCGCATCTGATCTGGAACGATCTTAGAGATCGTTTTTCTCAAGGAAATATGGCTCGTGTTTGCCAGCTGAAACAACAACTTCTTAATCTGAGGCAGGGATCTGAAGATGTAGGCTTAAAGAAATGGAGCAAGTACCAGATGCAAGAATGCTCGATGCAATTTCTCATCGGTTTGAATCTCACATTTGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779821.1
MVVSWLRNSVNSEISASIMYIDDAHLIWNDLRDRFSQGNMARVCQLKQQLLNLRQGSEDVGLKKWSKYQMQECSMQFLIGLNLTFAQIRSQIISMIHFPSLSRIFAMVLQEERQRSIEFVPQAPQINTENSGSMINATGYARGRGAKGKFLCTKCGKTNHTVDKCFEIIGYPPGYGRGRGKTQSDSGRSVNQVSGAESGNLSKASGTMTTADMAQIISFLQQQMQNIGGSSSTVSDTQSSKDSAPTNTSPPFSGTVSLAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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