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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003469`

染色体: Chr08 坐标: 37317360-37321441 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003469`
名称	SmilChr08G003469
描述	digalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37317360 - 37321441 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996593`
GeneID	`130996593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996593`
原始查询	`SmilChr08G003469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	digalactosyldiacylglycerol synthase 2, chloroplastic
产物	digalactosyldiacylglycerol synthase 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G00550` (DGD2) digalactosyl diacylglycerol deficient 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827960] identity=66.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0214400` - identity=63.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009707 (chloroplast outer membrane); GO:0019375 (galactolipid biosynthetic process); GO:0046481 (digalactosyldiacylglycerol synthase activity)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00534 (Glycos_transf_1); PF13692 (Glyco_trans_1_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057777871.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057777871.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057777871.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777871.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37318983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:37319094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:37319888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B129,B29,B50,C29
`Chr8:37320083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B69,B73,D2
`Chr8:37320177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:37321040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777871.1

462 aa

231

462

Glycos_transf_1

Glyco_trans_1_4

PF00534 Glycos_transf_1 219-334 aa PF13692 Glyco_trans_1_4 232-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777871.1`	Pfam	`PF00534`	Glycos_transf_1	Domain	219	334	6e-12	46.1	Glycosyl transferases group 1
`XP_057777871.1`	Pfam	`PF13692`	Glyco_trans_1_4	Domain	232	363	7.4e-11	43.2	Glycosyl transferases group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921888.1
GAATATTCGTCTTTATCAACCCAACTGAGCAATCACGCGCTCCGTACTTCCTCAAATTTAACAACTGTCACCACGCGCCTCCGAGCGTGCAACTATTTCCATTCCTTACAAAAAAATTTAACGCAACCATCTTTCGAATGTTCCCCTAATTTCCAGCTCACCTAGCTCAAAATCCAAATATTTAACCTAATTGTGTTTTTCTTGATTTAATTATTTAACTGCTGGTTTTCCTTGTTCAAAAGGTAGCAGAATCGATAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996593
ATGGATAAGAAACAACATATTGCAATATTTACTACGGCAAGCCTTCCATGGCTTACCGGGACTTCTGTCAACCCTCTGTTTCGTGCAGCGTATCTTGCAAAAGATGATCAGAGGAAAGTTACTTTGGTGATCCCTTGGTTGAAATTGGAGGACCAAAAACATGTGTATACCAACAAGATCACATTTGATTCAGCATCAGAACAAGAAACTTATGTGCGTCAGTGGCTTGAAGAAAGGACTGGATTCAGCTCAAGTTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777871.1
MDKKQHIAIFTTASLPWLTGTSVNPLFRAAYLAKDDQRKVTLVIPWLKLEDQKHVYTNKITFDSASEQETYVRQWLEERTGFSSSFTIRFYPGRFSIHKRSIIALGDITEVIPDEEADVAVLEEPEHLTWYHHGKRWKLKFRLVVGVVHTNYLEYVKREKNGQFQAFLLKYMNSWVVNIYCHQVIRLSAATQELPRSVICNVHGVNPKFLEIGMKKREQQQNETQPFTKGAYYIGKMVWHKGYKELLKLLSDNQKELTGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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