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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003472`

染色体: Chr08 坐标: 37344001-37346746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003472`
名称	SmilChr08G003472
描述	probable purple acid phosphatase 20
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37344001 - 37346746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996596`
GeneID	`130996596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996596`
原始查询	`SmilChr08G003472`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable purple acid phosphatase 20
产物	probable purple acid phosphatase 20
Arabidopsis	`AT3G52780` (PAP20) Purple acid phosphatases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824444] identity=61.6; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0151000` (OsPAP20b) - identity=57.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF14008 (Metallophos_C); PF16656 (Pur_ac_phosph_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057777879.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057777879.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777879.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777879.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37344175`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr8:37344175`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr8:37344432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37344445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:37344466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37345147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:37345186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:37345212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C8,D7
`Chr8:37345340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:37345402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B72,B77,C8,D7
`Chr8:37346465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777879.1

430 aa

215

430

Pur_ac_phosph_N

Metallophos

Metallophos_C

PF16656 Pur_ac_phosph_N 48-137 aa PF00149 Metallophos 145-338 aa PF14008 Metallophos_C 353-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777879.1`	Pfam	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	Domain	48	137	2.3e-23	83.3	Purple acid Phosphatase, N-terminal domain
`XP_057777879.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	145	338	1e-18	69.2	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057777879.1`	Pfam	`PF14008`	Metallophos_C	Domain	353	413	1.7e-22	80.5	Iron/zinc purple acid phosphatase-like protein C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921896.1
CTGTAAGACAGAGAAACGAAATATAAATAGCAAAGGACGCACGTAATTATATGCAAAACCGTGAGCAGCAGTCTGCTGATAAACGCTAGTTTTGAAATTGAGGTCTCCCTCAAGTCTGTTGCGTACCGTACGTGTGCTGTTTTTAAACCGCCGCGAATCTCATGCGTCTCGCGTTATCACCGTTTTCAATATAAAAACACAACCCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTGTCTTCAATCGTTAATCCATTTTCATTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996596
ATGATGGCCCCGACATCTTTAATTTTGTCACTGGCCTTTGCCGTGGCCATTGTTTCAGCCGCCGGATACCGCCGCCCGCCGCCGCGGGGATCCCTTTCTCGGTCGCTCTTAGAAGAACTCGATCACATTGATTCCACCACTCCCCAACAGGTGCACATATCTTTGAGCGGTGCAGAGCACATGAGAATATCATGGATCACATCAGATCCGAGTCCAGCAGTGGTGCACTATGGTACAACTCCCGAAGCTAACACCTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777879.1
MMAPTSLILSLAFAVAIVSAAGYRRPPPRGSLSRSLLEELDHIDSTTPQQVHISLSGAEHMRISWITSDPSPAVVHYGTTPEANTSSSNGTTATYNYLMYRSGEIHDVVIGPLHPNTVYYYRCGASSSSSPIFNFKTPPSQFPIQFVVTGDLGQTDWTRSTLKSIGKSDYDVLLLPGDLSYADTIQNLWDSFGQLAQPLASQRPWMVTQGNHEIEKIPLIHGEKFTAYNARWVMPFEGSGSTSNLYYSFEVGGVHVVMLG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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