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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003485`

染色体: Chr08 坐标: 37497080-37498927 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003485`
名称	SmilChr08G003485
描述	uncharacterized SmilChr08G003485
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37497080 - 37498927 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998428`
GeneID	`130998428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998428`
原始查询	`SmilChr08G003485`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=26.6; qcov=1.06; evalue=1.87e-26; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.1; qcov=0.789; evalue=1.04e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779826.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779826.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779826.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779826.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37497779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:37498284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:37498384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C7
`Chr8:37498386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C7
`Chr8:37498450`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498450`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498453`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498453`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B111,B69,C2
`Chr8:37498523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B69,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779826.1

426 aa

213

426

DUF674

PF05056 DUF674 7-333 aa PF05056 DUF674 341-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779826.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	7	333	1.3e-58	199.6	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057779826.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	341	407	1.3e-58	199.6	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923843.1
CCTATTCTCTGCGTGACGCTACGCTGCATCAAAACATCAATCACCATTGATTTCTCTCTTCCCTTACAAGATATATATATATATACACAATGTCTAGCGTTGATGGTACAAAGTTTACTCTCAAAGTGATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCAACAACTTCGTCGCCGACGCTTTGTTAGGCTTCCTAACCTTGCCCTTAGCAAAGATCTTGAGAATTCTGAGATATCATGAGATGTACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998428
ATGTCTAGCGTTGATGGTACAAAGTTTACTCTCAAAGTGATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCAACAACTTCGTCGCCGACGCTTTGTTAGGCTTCCTAACCTTGCCCTTAGCAAAGATCTTGAGAATTCTGAGATATCATGAGATGTACTACGGCTACAAGGCACCAGTCATTGGATCTTTAAGCCGCTTGTACATAAATCTATTTTGTAGTGATAATTCCAGTAAAAACGATGATAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779826.1
MSSVDGTKFTLKVMINKQKSKVLFAEANNFVADALLGFLTLPLAKILRILRYHEMYYGYKAPVIGSLSRLYINLFCSDNSSKNDDNKLLFMGSMSLEVEYRKLLGDIFPKDYICSDSNCPHYGYAKVKEVSEIGICVCGEPKCGRALTKPATFVISDDLRVVPMHSGFLQTLNNLGISDIHGAEPKSLNLEFHDVVNLLKLSLTSSTPLTDLVFKNSEIKPISPKIEPIHMGRGIINHAAKIILKVSLLKSTNNFLFAEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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