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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003490`

染色体: Chr08 坐标: 37523275-37525032 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003490`
名称	SmilChr08G003490
描述	uncharacterized SmilChr08G003490
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37523275 - 37525032 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998431`
GeneID	`130998431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998431`
原始查询	`SmilChr08G003490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=26.6; qcov=1.06; evalue=9.69e-27; confidence=low
Rice	`Os04g0594500` - identity=27.1; qcov=0.789; evalue=7.86e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779829.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779829.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779829.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779829.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37523325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A19,B140,B30,B41,B90
`Chr8:37523325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B140,B30,B41,B90
`Chr8:37523347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B140,B30,B41,B90
`Chr8:37523491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C59,C87
`Chr8:37523498`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B2
`Chr8:37523498`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B2
`Chr8:37523520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,C42,C59,C87
`Chr8:37523522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:37523535`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A19,A21,A23,B119,B19,B2,B24,B38,B39,B57,B61,B62,B64,B99,C42,C51,C52,C59,C65,C87,D4
`Chr8:37523537`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C13,C78
`Chr8:37523537`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C13,C78
`Chr8:37523539`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A21,A23,B119,B128,B19,B24,B38,B39,B57,B61,B62,B64,B75,B99,C51,C52,C65,C67,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779829.1

426 aa

213

426

DUF674

PF05056 DUF674 7-332 aa PF05056 DUF674 341-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779829.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	7	332	2.6e-58	198.7	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057779829.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	341	407	2.6e-58	198.7	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923846.1
ATGTCTAGCGTTGATGGTACAAAGTTGACTCTCAAAGTGATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCAACAACTTCGTCGCCGACGCTTTGTTAGGCTTCCTAACCTTGCCCTTAGCAAAGATCTTGAGAATTCTGAGATATCATGAGATGTACTACGGCTACAAGGCACCAGTCATTGGATCTTTAAGCCGCTTGTACATAAATCTATTTTGTAGTGATAATTCCAGTAAAAACGATGATAATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998431
ATGTCTAGCGTTGATGGTACAAAGTTGACTCTCAAAGTGATGATCAACAAACAGAAATCCAAGGTACTATTTGCAGAAGCCAACAACTTCGTCGCCGACGCTTTGTTAGGCTTCCTAACCTTGCCCTTAGCAAAGATCTTGAGAATTCTGAGATATCATGAGATGTACTACGGCTACAAGGCACCAGTCATTGGATCTTTAAGCCGCTTGTACATAAATCTATTTTGTAGTGATAATTCCAGTAAAAACGATGATAATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779829.1
MSSVDGTKLTLKVMINKQKSKVLFAEANNFVADALLGFLTLPLAKILRILRYHEMYYGYKAPVIGSLSRLYINLFCSDNSSKNDDNKLLFMGSMSLEVEYRKLLGDIFPKDYICSDSNCPHYGYAKVKEVSEIGICVCGEPKCGRALTKPATFVISDDLRVVPMHSGFLQTLNNLGISDIHGAEPKSLNLEFHDVVNLLKLSLTSSTPLTDLVFKNSEIKPISPKIEPIHMGRGIINHAAKIILKVSLLKSTNNFLFAEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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