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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003500`

染色体: Chr08 坐标: 37559635-37561373 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003500`
名称	SmilChr08G003500
描述	uncharacterized SmilChr08G003500
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37559635 - 37561373 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996617`
GeneID	`130996617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996617`
原始查询	`SmilChr08G003500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01140; symbol=AT5G01140; hit=AT5G01140; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01140; symbol=AT5G01140; hit=AT5G01140; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01140` (AT5G01140) - identity=28.8; qcov=1.01; evalue=2.09e-26; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=28.2; qcov=0.755; evalue=4.41e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777898.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777898.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777898.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777898.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37559810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B41,B46
`Chr8:37559836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B1
`Chr8:37559888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:37560105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B41,B98,D1
`Chr8:37560152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C45,C87,D1
`Chr8:37560158`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B14,B53,B98,C20,C22,C45,C87,D1
`Chr8:37560166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B75,D9
`Chr8:37560169`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B18
`Chr8:37560169`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B18
`Chr8:37560181`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	76	A11,A16,A20,A23,A24,A6,A7,A8,B119,B122,B126,B129,B13,B130,B133,B135,B14,B140,B15,B19,B20,B21,B26,B30,B31,B38,B4,B40,B41,B43,B47,B53,B54,B57,B66,B67,B68,B76,B77,B80,B85,B87,B88,B93,B94,B98,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C22,C27,C36,C42,C44,C45,C46,C52,C53,C55,C59,C63,C64,C66,C7,C71,C78,C87,C9,D1,D3,D4,D5,D9
`Chr8:37560184`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A7,B14,B38,B53,B98,C17,C20,C22,C45,C63,C7,C87,D1,D9
`Chr8:37560185`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A16,A20,A23,A24,A6,A8,B119,B122,B126,B129,B13,B130,B133,B135,B15,B19,B20,B21,B26,B30,B31,B4,B40,B41,B43,B54,B57,B66,B67,B68,B76,B77,B80,B85,B87,B88,B93,B94,C13,C16,C18,C19,C27,C36,C42,C44,C46,C52,C53,C55,C59,C64,C66,C71,C78,C9,D3,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777898.1

319 aa

160

319

DUF674

PF05056 DUF674 7-187 aa PF05056 DUF674 233-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777898.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	7	187	5.6e-53	181.1	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057777898.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	233	314	5.6e-53	181.1	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921915.1
TAATCCTTTGCAGAATGTCTGCCGATGAGGAGGAGGTTACGTTCTCGTTGAATGTGATGATCAATAAAGATAAAACTAAGGTACTCTTTGCAGAAACCGACAACCATTTTGTAGACATTTTGCTAAGCTTCTTGACTTTTCCGTTGGGAAGAATTATCAAACTCTTCAAGAAGCACTATGGTGATGAAGCTCCCACCATTGGAAGCTTAAGCACCGTAGCTTAGCAAATCTCGATAGCTCCCATTTTGTGACGGATGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996617
ATGAAGAAAAAAATAGTTCCGAAGAGTTCTGAAGCTGCTTCCAGGGATGGAGTATTTGCTATACATAAAGATTCTTTCATAATCTCCGACGATCTGCAGATCTTTCCAAATGAGATGGGAATCTCAGGAATCGTCACCATTGTTGGCATTGCAGACATGGATAAGGCTGAGTTGATCAAAGTTGATTTAGGGTTCAATGAGATTATGAACCTGTTAAAGGCATCCTTGACGTCTCCAACTCCATTGTCGGACCTCATATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777898.1
MKKKIVPKSSEAASRDGVFAIHKDSFIISDDLQIFPNEMGISGIVTIVGIADMDKAELIKVDLGFNEIMNLLKASLTSPTPLSDLILNKTIQMNSSTVESQLNIEEENANSKALSLKVIIQKSTGKFLYAQAKEDFVEFLFSFLHIPLGGVEHLLGRETRVKAIDNLYRSTADLINFKYFKSLNTKKRLMEPNLPHGCISDNHIFPLTEESLSPGYFINEVCLFSSLKFPNGQGSYLRGQRTYQVKDDLSVVPFCIVSIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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