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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003502`

染色体: Chr08 坐标: 37578515-37580132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003502`
名称	SmilChr08G003502
描述	uncharacterized SmilChr08G003502
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37578515 - 37580132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998434`
GeneID	`130998434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998434`
原始查询	`SmilChr08G003502`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G01130; symbol=AT5G01130; hit=AT5G01130; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G01130` (AT5G01130) - identity=26.9; qcov=1.01; evalue=1.7e-27; confidence=low
Rice	`Os01g0153500` - identity=29.5; qcov=0.74; evalue=3.59e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779833.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779833.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37578554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:37578583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B24,C14
`Chr8:37578587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B24,C14
`Chr8:37578590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B24,C14
`Chr8:37578609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B73,C14
`Chr8:37578625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B73,C14
`Chr8:37578637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B24,B79
`Chr8:37579323`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B62
`Chr8:37579323`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B62
`Chr8:37579351`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A25,B14,B25,B4,B42,B91,C23,C53,C6
`Chr8:37579354`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A25,B14,B25,B4,B42,B91,C23,C53,C6
`Chr8:37579375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B1,B96,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779833.1

339 aa

170

339

DUF674

PF05056 DUF674 5-233 aa PF05056 DUF674 256-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779833.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	5	233	1.3e-58	199.6	Protein of unknown function (DUF674)
`XP_057779833.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	256	332	1.3e-58	199.6	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923850.1
ATGTATTATGACAATGCTGGTAAATGCAGATGCTGCAATCGTCATCGAATGAAAAGAGAAGTAGCTGAGAACGATGCCCAGATTGTTCCTTTCTGTGATGGAGTTTTCACGAAGACGACGGCGTCTTTTGTGATTACTGATGATTTGCAGATAATGCCTAATTCTGGGCTCTTGCAAATTGTCAGTGCTCTTGGCGTTACTGACATGGATGAGGTCGAGACGATCAACATTACCTTTGGATTATTTGAGGTCGTGGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998434
ATGTATTATGACAATGCTGGTAAATGCAGATGCTGCAATCGTCATCGAATGAAAAGAGAAGTAGCTGAGAACGATGCCCAGATTGTTCCTTTCTGTGATGGAGTTTTCACGAAGACGACGGCGTCTTTTGTGATTACTGATGATTTGCAGATAATGCCTAATTCTGGGCTCTTGCAAATTGTCAGTGCTCTTGGCGTTACTGACATGGATGAGGTCGAGACGATCAACATTACCTTTGGATTATTTGAGGTCGTGGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779833.1
MYYDNAGKCRCCNRHRMKREVAENDAQIVPFCDGVFTKTTASFVITDDLQIMPNSGLLQIVSALGVTDMDEVETINITFGLFEVVELLEASLISTNPLSVVILDEEVLEMSSTEGKHEDQSPSTAANALISNSKTMNVKLVVQKSTNKLLYAEAEEDFVEFLFSFLVIPLGGVVSLLSRNSNLKPIDSLYKSADVLIHDKYFKNPADAKNRLIKPSIPHGYLSENHILPLNEERFLADLACNYYSLFPSSKFPKGQGSYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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