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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003505`

染色体: Chr08 坐标: 37592140-37593162 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003505`
名称	SmilChr08G003505
描述	uncharacterized SmilChr08G003505
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37592140 - 37593162 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996621`
GeneID	`130996621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996621`
原始查询	`SmilChr08G003505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G43240; symbol=AT5G43240; hit=AT5G43240; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT5G43240; symbol=AT5G43240; hit=AT5G43240; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G43240` (AT5G43240) - identity=42.9; qcov=0.44; evalue=1.03e-09; confidence=low
Rice	`Os05g0115600` - identity=40.8; qcov=0.447; evalue=2.61e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05056 (DUF674)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057777902.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057777902.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057777902.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777902.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37592579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B41,C5
`Chr8:37592656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr8:37592668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:37592674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B59,B98,C61
`Chr8:37592696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr8:37592710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B67,B71,B89,C16
`Chr8:37592746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B71,B89,C17,C42,C54
`Chr8:37592978`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B16,B71,C20
`Chr8:37592978`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B16,B71,C20
`Chr8:37592985`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B16,B71,C20
`Chr8:37592985`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B16,B71,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777902.1

159 aa

159

DUF674

PF05056 DUF674 68-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777902.1`	Pfam	`PF05056`	DUF674	Family	68	116	1.4e-13	51.2	Protein of unknown function (DUF674)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921919.1
TGCTCAAGGCTTCCTTGATGTCCTCGACCCCATTGTCGGATGTCATATTCAATAAAACAGGACAGATGAAATCTACAACATTAAAACTTCAACATATGACTTTATCGGATCAAATTGAAAATGCATCAACATTCTCCAAGGAGATGACTTTGAGATTGGTTGTACAAAATCTACTAATAAGGTCTTGTATGCTCAAGCTGAGGAAGATTTCGTAGAGCTTCTGTTCAGCTTCCTCATAATCCCACTAGGAGGCGTGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996621
ATGGACTTATTATACATGAGTGTGGCTGATCATATACACAGCAAATATTTGAAGACTGGTGCAAGAAACTTGCTAATCAAGCCCAAGATACCTCACGGCTATGTTTCCGAAAACCACATTCTTCCTCTCCCTGAAGAAGGCTTGCCTGGTTTCTACCAAGATATGTTGAATCTTTTTTCTTCTGTGAAGTTTCCAAATGGCCGGGGGAAATACCTCAAGGCACCGAGAACTTTCATGGTGACCGATGATTTAACTGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777902.1
MDLLYMSVADHIHSKYLKTGARNLLIKPKIPHGYVSENHILPLPEEGLPGFYQDMLNLFSSVKFPNGRGKYLKAPRTFMVTDDLTVTPLCITSALSFLNEMKIPMSDVKEVELQIGLKEALGILRASLTSDSTLSNGLNLSNQISQKQKNQLFESQVGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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