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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003507`

染色体: Chr08 坐标: 37639022-37643555 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003507`
名称	SmilChr08G003507
描述	F-box/LRR-repeat protein At1g67190
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37639022 - 37643555 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996624`
GeneID	`130996624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996624`
原始查询	`SmilChr08G003507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At1g67190
产物	F-box/LRR-repeat protein At1g67190
Arabidopsis	`AT1G67190` (AT1G67190) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843039] identity=70.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0859600` (OsFbox049) - identity=68.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777904.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057777904.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777904.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777904.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37641565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A14,A6,B138,B36
`Chr8:37641750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr8:37641752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr8:37642440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:37642567`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A5,B89
`Chr8:37642567`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A5,B89
`Chr8:37642576`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A1,A20,A3,A8,B114,B123,B126,B128,B139,B140,B15,B19,B21,B22,B26,B30,B45,B53,B55,B56,B71,B73,B74,B79,B96,C1,C18,C2,C23,C29,C44,C49,C61,C63,C64,C66,C71,C76,C78,C79,C9,D1,D11,D2
`Chr8:37642580`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A1,A20,A3,A8,B114,B123,B126,B128,B139,B140,B15,B19,B21,B22,B26,B30,B45,B53,B55,B56,B71,B73,B74,B79,B96,C18,C2,C29,C44,C49,C61,C63,C64,C66,C76,C78,C79,C82,C9,D1,D11,D2
`Chr8:37642597`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A20,A3,B15,B19,B21,B26,C49,C9
`Chr8:37642600`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,B15,B19,B21,C49,C9,D9
`Chr8:37642693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B91,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777904.1

419 aa

210

419

F-box-like

F-box

LRR_At5g56370

PF12937 F-box-like 2-36 aa PF00646 F-box 2-39 aa PF24758 LRR_At5g56370 126-229 aa

XP_057777905.1

419 aa

210

419

F-box-like

F-box

LRR_At5g56370

PF12937 F-box-like 2-36 aa PF00646 F-box 2-39 aa PF24758 LRR_At5g56370 126-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777904.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	36	1.2e-07	32.1	F-box-like
`XP_057777904.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	2	39	4.3e-05	24.0	F-box domain
`XP_057777904.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	126	229	4.2e-14	53.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057777905.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	2	36	1.2e-07	32.1	F-box-like
`XP_057777905.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	2	39	4.3e-05	24.0	F-box domain
`XP_057777905.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	126	229	4.2e-14	53.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009092699.1
GGTGAAGCTTGGTAGTGAGTAGAGCAATGAATAATAGAATGATTATAGTAATAGAATGATGAAATACAACCTAATTCTGGTGGATGTACAGTGCACACCACTTCTTTACGTGATACTCCTATTATACGCCGTCGCACTGGTGTTTTACAGCTTGACCTTTTCCCCCGTCTTTCAGCGAATCAGATTCCACTATTTCCATTCTTCTCCACTCTCTCTCGTTTTCACCCAAATCTCTGTCTTCTGATTTATGCATACGATTT...

XR_009092698.1
GGTGAAGCTTGGTAGTGAGTAGAGCAATGAATAATAGAATGATTATAGTAATAGAATGATGAAATACAACCTAATTCTGGTGGATGTACAGTGCACACCACTTCTTTACGTGATACTCCTATTATACGCCGTCGCACTGGTGTTTTACAGCTTGACCTTTTCCCCCGTCTTTCAGCGAATCAGATTCCACTATTTCCATTCTTCTCCACTCTCTCTCGTTTTCACCCAAATCTCTGTCTTCTGATTTATGCATACGATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996624
ATGGAGTCTCTTCCAGTTGAGGTTGTTGGGAACATTCTATCGCGTCTTGGAGCTGCTCGTGATGTTGTGATTGCATCAGCAACTTGCCGGAAATGGCATGAGGCTTGGAGGAATCATCTCCACACTCTTACATTTAATTCCAACGACTGGCCTTTGTATCATGATTTTTCCACTTCTAGACTCGAAATCATTATTACTCAGACTATATTCCAGACCAAAGGACTGCAGTGCCTTTCAATAATTATGGATGATGTAGACGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777904.1
MESLPVEVVGNILSRLGAARDVVIASATCRKWHEAWRNHLHTLTFNSNDWPLYHDFSTSRLEIIITQTIFQTKGLQCLSIIMDDVDEFSAAPVIAWLMYTRETLRQLHYNVRTQPNINMLEKCGRQKLEVLALAHNTITGVEPSYQKFPCLKSLSLSYVSISALDLSLLLNACPKIEYLILISLDIVMSDPQATMDLSSHSLKDVYVEAISLDKFILEADSLEKLHLKDCTLEVFELVGKGMLRFLKIDDVSVIHLDIGE...

XP_057777905.1
MESLPVEVVGNILSRLGAARDVVIASATCRKWHEAWRNHLHTLTFNSNDWPLYHDFSTSRLEIIITQTIFQTKGLQCLSIIMDDVDEFSAAPVIAWLMYTRETLRQLHYNVRTQPNINMLEKCGRQKLEVLALAHNTITGVEPSYQKFPCLKSLSLSYVSISALDLSLLLNACPKIEYLILISLDIVMSDPQATMDLSSHSLKDVYVEAISLDKFILEADSLEKLHLKDCTLEVFELVGKGMLRFLKIDDVSVIHLDIGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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