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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003519`

染色体: Chr08 坐标: 37815269-37816530 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003519`
名称	SmilChr08G003519
描述	uncharacterized SmilChr08G003519
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37815269 - 37816530 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996637`
GeneID	`130996637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996637`
原始查询	`SmilChr08G003519`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.6; qcov=0.556; evalue=5.85e-09; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=29.4; qcov=0.635; evalue=2.11e-20; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777915.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057777915.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777915.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777915.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057777915.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37815549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C77,C80,C81
`Chr8:37815551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,D8
`Chr8:37815572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B23,C25
`Chr8:37815589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr8:37815631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C45
`Chr8:37815650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,D11
`Chr8:37815663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B19,B75,C10
`Chr8:37815687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B1,B122,B16,B36,B85,B87,B97,C16,C23
`Chr8:37815698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,B97
`Chr8:37815699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:37815706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr8:37815715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777915.1

241 aa

120

241

SWIM

PF04434 SWIM 87-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777915.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	117	2.1e-08	34.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921932.1
ACGGTAAGGCAGTGGTAGAGGTGTATCGACAAGATGCATTTGCGTACGAGAAATCTGACTTCACTAGGGCTATGAACGCCCTAAAGGTTATGAAGAGAGCCGCGTACGATAAACTAATGGGGATTGGGCCGGAAAAGTGGGCTCGTTCGATGTGTCCTATGCCTGTGTGACGCTACAGTTTTATGACATCAAATGCTGCTGAAGCTTTTAATGCCAGATTGTTGTGGGCAAGAAGACTTCCTATCTGCTCAATGTTAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996637
ATGACATCAAATGCTGCTGAAGCTTTTAATGCCAGATTGTTGTGGGCAAGAAGACTTCCTATCTGCTCAATGTTAAAGGCAATCAGACTTGTTATTGAGAAATGGTTCAGCGAGCGACTAAGGGCTGCACAACAAAACGAGGAAGTCTTGTCTGCTGAGGCCGGTAAAAGGGTAGCTATTGAAGTCCAAAAAAGTCGTCGATACACTGCACAAAGGTTGAGTGGCCGGAAGTATAAGGTGCAAACTGCTGACAGAAGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777915.1
MTSNAAEAFNARLLWARRLPICSMLKAIRLVIEKWFSERLRAAQQNEEVLSAEAGKRVAIEVQKSRRYTAQRLSGRKYKVQTADRSFKVDLEKKKCECRAFQLHQLPCSHSIAAISEAGDTIAEYVDSYYTNEFLIDTYYGEVNNLPSRHQWLVPEYIAESVVLPLIVKVNWGAQKKVDIEVVVKAATYKQMSLLVSGVVNQRSAASAMKKDTTRERTLAGRLSPGSSGLYLCVVTVNDID

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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