当前解析结果
SmilChr08G003522| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003522 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003522 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003522 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 37824665 - 37825477 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998438 |
|---|---|
| GeneID | 130998438 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998438 |
| 原始查询 | SmilChr08G003522 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998438 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057779836.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057779836.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057779836.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057779836.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057779836.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:37824677 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A4,B111,B127,B13,B131,B140,B22,B50,B56,B59,B85,C23,C46,C62,C76 |
Chr8:37824683 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | B101,B105,B15,B20,B35,B40,B41,B43,B6,B67,B83,B91,C21,C30,C37,C64,C72,C85,D1,D6 |
Chr8:37824704 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,C19,C3 |
Chr8:37824705 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A8,C33 |
Chr8:37824710 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,C79 |
Chr8:37824713 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B36,C5,C72 |
Chr8:37824723 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B15,C47 |
Chr8:37824723 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B15,C47 |
Chr8:37824726 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B140,B50 |
Chr8:37824728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B140,B50,D7 |
Chr8:37824728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B50,D7 |
Chr8:37824731 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A18,B12,B131,B24,C14,C41 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。