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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003524`

染色体: Chr08 坐标: 37844986-37853046 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003524`
名称	SmilChr08G003524
描述	uncharacterized protein At5g03900, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37844986 - 37853046 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996639`
GeneID	`130996639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996639`
原始查询	`SmilChr08G003524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831927]; symbol=AT5G03900; hit=AT5G03900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831927]; symbol=AT5G03900; hit=AT5G03900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G03900` (AT5G03900) Iron-sulfur cluster biosynthesis family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831927] identity=65; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0533000` - identity=67.2; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057777917.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057777917.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057777917.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057777917.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777917.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37845274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B15,C22,C4
`Chr8:37845283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C1,C50
`Chr8:37845719`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:37845719`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37845722`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr8:37845722`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr8:37846113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr8:37847427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:37851987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C14,C27
`Chr8:37852007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:37852183`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,A23,A4,B109,B18,B53,B92,C1,C11,C29,C69,C9,D3
`Chr8:37852334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921934.1
TAAATGAAGATAAAACAACTAATCCTGTCATTATTGATGGAGATATTGGGGGTTATAACCTAAATCGGTTCATGAATGAGTTAATTGTAGAAAGCTTTCATAGATGAAAAGTATCAGAAATTTGAAGCTGCTGCAAAAACAAGTAAATATGTTACAAATATGAGGGTGAAAACGTGAAATGTTAGCGACTTTGACACCAGGAAAAATAACGATCTTCATCTACGGCGCTCATACAATATATATTCCACTACAAAAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996639
ATGGCGTCTATGTCCGCCTGCTTCTTCTCTCCAACTCCAAAAACTCGCTCCTTTACCCTCACTCACAAACCATTTAAGCCTTCAGAATTCCTCTATTTTACTCCAGCTCCCACCCGCCCGACCAAATTCCGGTGCGGCAGAGCCTCCGGTTTGGTAATTAGGGCTAGCAGTAGCAACAGCGCCGGTGTCGATGTCACCACGGTGTCGGGGATTAGGCCCGGCGGCGCCGTCGAGAGCGATAAGCTGCCGACCGACGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777917.1
MASMSACFFSPTPKTRSFTLTHKPFKPSEFLYFTPAPTRPTKFRCGRASGLVIRASSSNSAGVDVTTVSGIRPGGAVESDKLPTDVRKRTMDAIDSSGRRVTVGDVASKAGLKLNEAQRALQALAADTDGFLEVSDEGDVLYAFPKDYRSKLASKSIKIKFEPLLEKGKMAAEYVVRVSFGTALIASIVIVYTTIIAIVSSSRESDDRGRRGRSYGSGVNFFFSPTDLFWYWDPNYYRRRRARDSDGGMNFIESVFSVVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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