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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003533`

染色体: Chr08 坐标: 37946667-37948333 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003533`
名称	SmilChr08G003533
描述	alpha carbonic anhydrase 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	37946667 - 37948333 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996651`
GeneID	`130996651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996651`
原始查询	`SmilChr08G003533`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha carbonic anhydrase 1, chloroplastic
产物	alpha carbonic anhydrase 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G52720` (ACA1) alpha carbonic anhydrase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824438] identity=40.8; qcov=0.981; evalue=3.62e-76; confidence=medium
Rice	`Os02g0533300` (OsalphaCA1) - identity=49.6; qcov=0.867; evalue=5.2e-85; confidence=high
GO	GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00194 (Carb_anhydrase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057777929.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057777929.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057777929.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777929.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:37947058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C46
`Chr8:37947228`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B17
`Chr8:37947228`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B17
`Chr8:37947234`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr8:37947234`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr8:37947364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr8:37947541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,C32,C9,D8
`Chr8:37947698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C30,D8,D9
`Chr8:37947707`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A16,C30,D8
`Chr8:37947707`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A16,C30,D8
`Chr8:37947850`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:37947850`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777929.1

270 aa

135

270

Carb_anhydrase

PF00194 Carb_anhydrase 41-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777929.1`	Pfam	`PF00194`	Carb_anhydrase	Domain	41	266	3.7e-37	129.0	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921946.1
TGAGTCTTCAGAGCACACTCAATAATTCAAGATTCAGACATTCATACTTATCTTGAGTATATTGGGAGTGGTTGGGGTCGTGTCCAAACTTTTTTAGGAAATTTTGGTGTTGTCCACACTATTACTAATAATTCCAACCAAAAAAACCTTAGATATTTGACAAACTCAGGTGTCTCTTTCTGCAATTAGATGAAGTGTTTTCCCAAAAGATGCTGTTGACAAAAAGACACGCGAAAAAAGTTGAGGGTGCGAAGAAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996651
ATGGCTGGTTTGTTGAGTGTGACAGCGCTTACTCTGCTGATGCTTCTAGGCTCAGATGCTTTTACTACATCGAAGGTGGAGAAGGCAGTGCAACTGCAGTTCACATACTCGGGAGCAATGGGGCCGGACAAGTGGGCCAGTTTGAATCCCAACTTCTCCCTCTGCGCCACTGGCAAACTGCAGTCGCCGATCAACATTGTTTCGGACCGAGCTGTCCGAAGCACCAAGTTGAAGGCCCTCGTCAGAGATTACCGCGCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777929.1
MAGLLSVTALTLLMLLGSDAFTTSKVEKAVQLQFTYSGAMGPDKWASLNPNFSLCATGKLQSPINIVSDRAVRSTKLKALVRDYRAVNVTLVDNKFTVAIEYPDDTGGISVDEKQYALKQMHWHSPSEHRINGKRFAAELHMVHVSEDAKVVVVATLYQLGHPDPLLQTIYKKLNELASEYKSSEATAPIQVGVLEAAELRTTPSKYYRYVGSSSVPPCAEHLVYIVLAQATSISKQQVAALKAPLDIRCKYNARPCQPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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