当前解析结果
SmilChr08G003538| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003538 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003538 |
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 38030295 - 38031421 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998442 |
|---|---|
| GeneID | 130998442 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998442 |
| 原始查询 | SmilChr08G003538 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like |
| 产物 | mitochondrial import receptor subunit TOM9-2-like |
| Arabidopsis | AT5G43970 (TOM22-V)translocase of outer membrane 22-V [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834420] identity=50.5; qcov=1.09; evalue=4.46e-18; confidence=low |
| Rice | Os02g0131600- identity=61.2; qcov=0.576; evalue=5.34e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998442 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057779839.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057779839.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.40000 | XP_057779839.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779839.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779839.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:38030550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B124 |
Chr8:38030551 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A25,B37,C32 |
Chr8:38030591 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A25,B28 |
Chr8:38030593 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A6,B113,B20,B45,B66,B8,C10,C26 |
Chr8:38030614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B41 |
Chr8:38030614 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr8:38030633 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,B45 |
Chr8:38030642 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C14 |
Chr8:38031180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr8:38031186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B16 |
Chr8:38031235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,B51,B54 |
Chr8:38031246 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。