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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003540`

染色体: Chr08 坐标: 38049216-38050679 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003540`
名称	SmilChr08G003540
描述	uncharacterized SmilChr08G003540
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38049216 - 38050679 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996653`
GeneID	`130996653`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996653`
原始查询	`SmilChr08G003540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831685]; symbol=AT5G03870; hit=AT5G03870; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831685]; symbol=AT5G03870; hit=AT5G03870; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G03870` (AT5G03870) Glutaredoxin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831685] identity=47.7; qcov=1; evalue=2.19e-104; confidence=high
Rice	`Os04g0412800` (OsGRL8) - identity=37.6; qcov=1.15; evalue=2.35e-72; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00462 (Glutaredoxin); PF23733 (GRXCR1-2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996653

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777932.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057777932.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057777932.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777932.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38049413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C31
`Chr8:38049428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:38049560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C61
`Chr8:38049668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B123,B37
`Chr8:38049858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:38049910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:38050051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:38050133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C31
`Chr8:38050168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:38050264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:38050324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C59
`Chr8:38050351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777932.1

413 aa

206

413

Glutaredoxin

GRXCR1-2_C

PF00462 Glutaredoxin 267-334 aa PF23733 GRXCR1-2_C 364-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777932.1`	Pfam	`PF00462`	Glutaredoxin	Domain	267	334	1.1e-09	39.1	Glutaredoxin
`XP_057777932.1`	Pfam	`PF23733`	GRXCR1-2_C	Domain	364	410	4.8e-15	55.9	GRXCR1/2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921949.1
TTAAGAAACAGAGCACACATTCGAAAACTACCTGAAAATTCACTCTCCCCCAAAATCAAATGGGCTGCGTTTCCTCAAAACTGGTAGCTAAAGAAATCCAGCAGGAAAAAAGATCACGCCGAAATGCCGATTACGCCCACCACGTCGTTTCCCTCACTTCAACTACCTACGGCGCTCTCTCACTAGACAAAGCAAAGGTTCGAATTCCTCCGCCGCCGCAGGAGCATGTAGAATCGGAAGCGAGCAGCAAAGAATGCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996653
ATGGGCTGCGTTTCCTCAAAACTGGTAGCTAAAGAAATCCAGCAGGAAAAAAGATCACGCCGAAATGCCGATTACGCCCACCACGTCGTTTCCCTCACTTCAACTACCTACGGCGCTCTCTCACTAGACAAAGCAAAGGTTCGAATTCCTCCGCCGCCGCAGGAGCATGTAGAATCGGAAGCGAGCAGCAAAGAATGCGGGGCCAGGAAATCGTCATCGTCATCGTCATCGTCACCGTACCGCGAAGAGCCGGCGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777932.1
MGCVSSKLVAKEIQQEKRSRRNADYAHHVVSLTSTTYGALSLDKAKVRIPPPPQEHVESEASSKECGARKSSSSSSSSPYREEPAEIINAWELMEGLEEEIAIVVQSKRSPKSKLFLRGFSEKDPMSPLKFLNQMTSPRKAKKVTGKENKGRVSGIRSSENSPKPILKESNNNNSVKKPSPKLWASIKGNPKCDSSRFDSGIVTSRRRSLGPLFDPDLVASLEKEVSEEEEEIKKMVSSTNVIKSQNSDTFLESYKKKCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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