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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003541`

染色体: Chr08 坐标: 38063528-38066305 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003541`
名称	SmilChr08G003541
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g57790-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38063528 - 38066305 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996654`
GeneID	`130996654`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996654`
原始查询	`SmilChr08G003541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g57790-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At1g57790-like
Arabidopsis	`AT1G57790` (AT1G57790) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842154] identity=42.6; qcov=0.906; evalue=7.16e-96; confidence=medium
Rice	`Os01g0183800` (OsFbox004) - identity=23.4; qcov=0.823; evalue=1.03e-08; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996654

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777933.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057777933.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057777933.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057777933.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777933.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38065204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B37
`Chr8:38065307`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A21,A3,A6,B104,B106,B109,B117,B119,B120,B125,B127,B137,B139,B14,B2,B28,B29,B30,B43,B44,B45,B47,B52,B56,B59,B65,B66,B67,B71,B8,B86,B90,B93,C16,C25,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C6,C62,C69,C7,C70,C71,C79,C80,C86,C87,C9,D11,D5
`Chr8:38065310`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A21,A6,B104,B106,B109,B119,B120,B125,B127,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B52,B56,B59,B66,B67,B8,B90,C16,C25,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C79,C80,C86,C87,C9,D11
`Chr8:38065325`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A6,B104,B106,B109,B119,B120,B127,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B56,B59,B66,B67,B8,B90,C25,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C79,C86,C87,C9
`Chr8:38065329`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A6,B104,B106,B109,B119,B120,B127,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B56,B59,B66,B67,B8,B90,C25,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C79,C86,C87,C9,D11
`Chr8:38065336`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A6,B104,B106,B109,B119,B120,B127,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B59,B66,B67,B8,B90,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C79,C86,C87,C9,D11
`Chr8:38065341`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A10,A6,B104,B106,B109,B117,B119,B120,B125,B127,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B59,B66,B67,B8,B90,C25,C34,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C79,C86,C87,C9,D11
`Chr8:38065349`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A10,A6,B104,B106,B109,B117,B119,B125,B137,B139,B14,B2,B29,B30,B43,B44,B45,B66,B67,B90,C25,C38,C39,C41,C42,C51,C52,C53,C55,C56,C58,C69,C7,C71,C86,C87,C9
`Chr8:38065386`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A10,B67
`Chr8:38065386`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A10,B67
`Chr8:38065390`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	B106,B14,B29,B45,B66,B8,C42,C51,C55,C71,C86
`Chr8:38065396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B106,B67,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777933.1

373 aa

186

373

F-box-like

F-box

Beta-prop_KIB1-4

PF12937 F-box-like 34-68 aa PF00646 F-box 34-69 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 91-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777933.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	34	68	3.4e-08	33.8	F-box-like
`XP_057777933.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	34	69	1.4e-07	31.8	F-box domain
`XP_057777933.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	91	325	1.4e-31	110.6	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921950.1
CCCTTTCAAAACCCACACGTGTTAATTGGAAACATGTTTTTTGTAGCAATCTCTCACACGCCCTGACACCACAATCATTCTCCCCTTCACAACCCTCTCCTCCTCTTTACTTTTTTTTTAACACACACAAACACACACCCTGAAACCCAAAAGAACATTATTTTCCCGTGAAATTCAATTTGGGTTTCGTCAATTATGGCTGGAAGAAGAAGAAAAAAGATGAAGTTGTTGGCTGAAACAATCAGAGACAATGGTAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130996654
ATGGCTGGAAGAAGAAGAAAAAAGATGAAGTTGTTGGCTGAAACAATCAGAGACAATGGTAGAGTTTCGAAGAGACAGCGTGATGAGCAACAAACACAGTCGGAGCTCCCAACAGAGCTTTTGGAACTTATTCTTTCTCAGTTAAGCTTGAGGGATAATATTCGTGCTTCTGCTGTTTGCAGAGAATGGTTAGCTGTTGCTGTATCTGTCAGAATGGCCAACAAGCCTCCGTGGCTTATGTTCTTCCCAAAATTCGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057777933.1
MAGRRRKKMKLLAETIRDNGRVSKRQRDEQQTQSELPTELLELILSQLSLRDNIRASAVCREWLAVAVSVRMANKPPWLMFFPKFGDLYEFYDPSQRKTYWLELPELDGSRICYAKDGWLLLYKPRTQSVFFCCPYTRELINLPSLELMYQIVAFSAAPTSPSCILFTVKHVSPTVVAVSTCRPGETEWTTVNYQNRLPFVSSIWNKLVFCQGLFYCLSLTGWLGVYDPEKSTWAVHSVPPPKCPENFFVKNWWKGKFMT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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