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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003542`

染色体: Chr08 坐标: 38066815-38068000 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003542`
名称	SmilChr08G003542
描述	replication protein A 14 kDa subunit B-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	38066815 - 38068000 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130996655`
GeneID	`130996655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130996655`
原始查询	`SmilChr08G003542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 14 kDa subunit B-like
产物	replication protein A 14 kDa subunit B-like
Arabidopsis	`AT4G18590` (AT4G18590) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827591] identity=67.9; qcov=1; evalue=1.63e-53; confidence=high
Rice	`Os01g0253600` (OsRPA14) - identity=51.9; qcov=1; evalue=2.51e-40; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006310 (DNA recombination)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03430 (Mismatch repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03440 (Homologous recombination - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03460 (Fanconi anemia pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08661 (Rep_fac-A_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130996655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057777934.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057777934.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057777934.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057777934.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057777934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:38067526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:38067650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057777934.1

106 aa

106

Rep_fac-A_3

PF08661 Rep_fac-A_3 1-100 aa

XP_057777935.1

106 aa

106

Rep_fac-A_3

PF08661 Rep_fac-A_3 1-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057777934.1`	Pfam	`PF08661`	Rep_fac-A_3	Domain	1	100	3.7e-22	79.4	Replication factor A protein 3
`XP_057777935.1`	Pfam	`PF08661`	Rep_fac-A_3	Domain	1	100	3.7e-22	79.4	Replication factor A protein 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057921952.1
GGAATATTTGGCGCCATTTCTTCCCCCATTTTGACGAGCTTTTTAAATGTAATTTTTTGATCAATAAATTAAATCCTTATTTCAATTCAAAGGGTTTCGCTCAGTACACTTGGATTAACCTACAACTCTAAAGAAAATGGATACATCGAATCCAGCGGTTTTTGTGAACGCGGAGTTGCTGCGGATGCATATCGGCAAGAGAGTTCGCGCGGTAATTCAGGTGCTCAGAAACGACGGCGGCTCAATTATCGGAAAATCGA...

XM_057921951.1
TTCCCCCATTTTGACGAGCTTTTTAAATGTAATTTTTTGATCAATAAATTAAATCCTTATTTCAATTCAAAGGGTTTCGCTCAGTACACTTGGATTAACCTACAACTCTAAAGAAGAAAATGGATACATCGAATCCAGCGGTTTTTGTGAACGCGGAGTTGCTGCGGATGCATATCGGCAAGAGAGTTCGCGCGGTAATTCAGGTGCTCAGAAACGACGGCGGCTCAATTATCGGAAAATCGACCGATGAGCAACAGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130996655
ATGGATACATCGAATCCAGCGGTTTTTGTGAACGCGGAGTTGCTGCGGATGCATATCGGCAAGAGAGTTCGCGCGGTAATTCAGGTGCTCAGAAACGACGGCGGCTCAATTATCGGAAAATCGACCGATGAGCAACAGCTGGTCGTCAAGGGGCACCCTTCTAGCCCCCCCACGACTTTTCTCGAGGTTATCGGCATCGCTGACACTAACCAGTCTATTCAGGCTGAGATTTGGACCAATTTTGGCGATGATTTTGATAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057777934.1
MDTSNPAVFVNAELLRMHIGKRVRAVIQVLRNDGGSIIGKSTDEQQLVVKGHPSSPPTTFLEVIGIADTNQSIQAEIWTNFGDDFDISSYNAVCQLANGDFKHLFI

XP_057777935.1
MDTSNPAVFVNAELLRMHIGKRVRAVIQVLRNDGGSIIGKSTDEQQLVVKGHPSSPPTTFLEVIGIADTNQSIQAEIWTNFGDDFDISSYNAVCQLANGDFKHLFI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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